Беседин Иван Сергеевич родился 13 февраля 1954 г. в Баку.
В 1976 г. окончил Московский институт инженеров железнодорожного транспорта (МИИТ) по специальности "инженер-электрик". После его окончания работал в том же вузе младшим научным сотрудником, старшим инженером, старшим научным сотрудником, учился в аспирантуре.
В 1984 г. защитил диссертацию на степень кандидата технических наук по теме "Технологические и экономические основы формирования парка погрузочно-разгрузочных машин на грузовых станциях".
В 1985 г. перешел на работу в систему министерства путей сообщения СССР и РФ. Занимал должности главного эксперта, начальника отдела, первого заместителя начальника Главного экономического управления МПС. В 1992 г. был назначен начальником Управления экономики и развития министерства, в том же году являлся генеральным директором АОЗТ "Единая транспортная биржа".
В 1993 г. занял пост заместителя, а в 1995 г. - первого заместителя министра путей сообщения РФ.
В 1999 г. был назначен заместителем начальника Московской железной дороги.
С 2000 по 2001 г. - заместитель председателя Организации сотрудничества железных дорог (ОСЖД) в Польше.
В 2002-2003 гг. занимал должность статс-секретаря, заместителя председателя Федеральной энергетической комиссии.
В сентябре 2003 г. возглавил Всероссийский научно-исследовательский институт железнодорожного транспорта. С сентября 2006 г. по февраль 2011 г. занимал должность начальника Калининградской железной дороги.
С 7 февраля 2011 г. - начальник ГУП "Московский метрополитен".
Награжден орденом Дружбы (1993), медалью "За развитие железных дорог" (2008), благодарственной грамотой президента России (2011).
Женат, супруга - Нина Ивановна, бывшая школьная преподавательница. У них есть двое сыновей: Сергей и Александр и дочь - Анастасия. По данным СМИ, дети работают в сфере транспорта.