Ваш регион:
^
Все новости
Новости Поиск Темы
ОК
Применить фильтр
Вы можете фильтровать ленту,
выбирая только интересные
вам разделы.
Идёт загрузка

Ученые нашли новый способ анализа совокупности генов

15 июня 2016, 18:09 UTC+3 МОСКВА МОСКВА 15, июня. /ТАСС

Новая разработка позволит сравнивать микрофлору здорового человека с микрофлорой больного и находить ранее неизвестные патогенные микроорганизмы

Поделиться
Материал из 1 страницы
© ИТАР-ТАСС/Артем Коротаев

МОСКВА, 15 июня. /ТАСС/. Ученые из Санкт-Петербургского университета информационных технологий, механики и оптики (Университета ИТМО), Федерального научно-клинического центра физико-химической медицины и Московского физико-технического института разработали программу для анализа и сравнения между собой совокупностей ДНК микроорганизмов, обитающих в разных средах, сообщает пресс-служба Университета ИТМО. Новая разработка позволит сравнивать микрофлору здорового человека с микрофлорой больного и находить ранее неизвестные патогенные микроорганизмы, чтобы разрабатывать средства персонализированной медицины. Результаты исследования опубликованы в журнале Bioinformatics.

"В микрофлоре кишечника пациента могут быть выявлены микроорганизмы, ассоциируемые с каким-либо заболеванием, например, с диабетом или предрасположенностью к нему. А это уже предпосылки для применения персонализированной медицины и создания новых лекарств", - приводит пресс-служба слова главного разработчика алгоритма, сотрудника Международной лаборатории "Компьютерные технологии" Университета ИТМО Владимира Ульянцева.

Программа под названием MetaFast, разработанная учеными, позволяет проводить сравнительный анализ большого количества метагеномов и находить патогенные микроорганизмы без необходимости их выделения и культивирования. Метагеном - это совокупность генов всех микроорганизмов, проживающих в одной среде, например, в кишечнике человека. По метагеному можно определить заболевания и предрасположенность к ним. Поэтому изучение совокупности микроорганизмов, населяющих различные отделы человеческого организма, занимает особое место в метагеномных исследованиях.

Программа позволяет найти в любой среде все возможные гены, даже неизвестные прежде, и одновременно выделить в метагеноме закономерности, которые отличают одних пациентов от других, например, больных людей от здоровых. Пока нет баз данных, в которых приведены микроорганизмы, ассоциируемые с конкретными заболеваниями, поэтому MetaFast может помочь в поиске этих причинно-следственных связей.

С помощью MetaFast можно не только обнаруживать патогенные микроорганизмы. К примеру, сравнение метагеномов самобытных народов в замкнутых популяциях с жителями городов может помочь выделить бактериальные штаммы, полезные для людей, но утерянные в процессе урбанизации. По словам ученых, MetaFast показал высокую эффективность при исследовании редких и неизведанных метагеномов.

В мире уже накоплено гигантское количество экспериментальных данных по различным метагеномам. Поэтому особенно сейчас важна разработка программных средств для анализа данных по метагеномам.

Показать еще
Поделиться
Новости smi2.ru
Новости smi2.ru
Загрузка...
Реклама
Новости партнеров
Реклама
Читайте
ТАСС VK
Много новостей? Мы собрали главные в нашей рассылке!