За время своей работы Государственная дума РФ собственным решением лишь трижды лишала депутатов полномочий.
6 октября 1995 г. Госдума первого созыва своим решением лишила мандата независимого депутата Сергея Мавроди за "пренебрежении депутатскими обязанностями" и занятие коммерческой деятельностью. Ранее, 5 апреля того же года, Дума рассматривала запрос Генеральной прокуратуры РФ о лишении парламентария иммунитета в связи с возбуждением в отношении него уголовного дела по факту финансовых махинаций в компании "МММ" (финансовая пирамида). Тогда депутаты сперва высказались за лишение Мавроди неприкосновенности, но затем провели повторное голосование, на котором восстановили иммунитет своего коллеги. Лишь полгода спустя думская мандатная комиссия предложила досрочно прекратить полномочия Сергея Мавроди. 28 апреля 2007 г. он был приговорен Чертановским районным судом Москвы к 4 годам и 6 месяцам заключения по обвинению в мошенничестве в крупных размерах. 22 мая того же года вышел на свободу в связи с истечением срока наказания, большую часть которого он отбыл в СИЗО.
14 сентября 2012 г. Госдума приняла решение о досрочном прекращении полномочий депутата шестого созыва, заместителя руководителя фракции "Справедливая Россия" Геннадия Гудкова. Поводом послужило его занятие предпринимательской деятельностью и членство в органах управления коммерческих организаций (в частности, компаний "Инглиш Вилладж", "Рошан"), что является нарушением закона о статусе депутата. Соответствующие документы были представлены в Госдуму Следственным комитетом и Генпрокуратурой РФ в августе 2012 г. Геннадий Гудков пытался оспорить решение о лишении его мандата в Верховном суде (ВС) РФ. Однако 12 февраля 2013 г. суд, а затем - 11 апреля того же года - Апелляционная коллегия ВС подтвердили законность решения Госдумы.
22 мая 2015 г. Госдума шестого созыва лишила мандата члена фракции КПРФ Константина Ширшова, осужденного на 5 лет по обвинению в мошенничестве в особо крупном размере. Его полномочия считаются досрочно прекращенными с 15 апреля 2015 г., с момента вступления приговора суда в законную силу. Ширшов обвинен в том, что вместе с соучастниками требовал от предпринимателя Александра Чернякова €7,5 млн за содействие в получении депутатского мандата. 26 мая 2014 г. Мосгорсуд приговорил парламентария к 5 годам колонии общего режима со штрафом в размере 700 тыс. рублей, он был взят под стражу в зале суда.