Родился 29 марта 1975 г. в Грозном Чечено-Ингушской АССР (ныне столица Чеченской Республики). По национальности - чеченец. Отец - Ваха Абуевич Агаев (1953-2020), был основателем и главой компании "Юг-Нефтепродукт", в 2011-2020 гг. - депутатом Государственной думы РФ от КПРФ.
В 1996 г. окончил Московский государственный университет коммерции (с 2002 г. - в составе Российского государственного торгово-экономического университета, который в свою очередь в 2012-2014 гг. был реорганизован и объединен с Российским экономическим университетом им. Г. В. Плеханова). В 2004 г. окончил Всероссийскую академию внешней торговли Министерства экономического развития РФ, в 2007 г. - экономико-математический факультет Российского экономического университета им. Г. В. Плеханова.
Кандидат экономических наук. В 2000 г. в Кабардино-Балкарской государственной сельскохозяйственной академии защитил диссертацию на тему "Организационно-экономический механизм обеспечения продовольственной безопасности".
C 2003 по 2011 г. занимал пост вице-президента ООО "Юг-Нефтепродукт".
В 2011-2016 гг. – депутат Государственной думы РФ VI созыва. Участвовал в выборах 4 декабря 2011 г. по списку партии "Единая Россия" в составе региональной группы №18 от Удмуртской Республики (под четвертым номером). По итогам распределения мест в Госдуму не прошел, однако 15 декабря 2011 г. Бекхану Агаеву был передан ставший вакантным мандат Николая Мусалимова, главы Всеудмуртской ассоциации "Удмурт кенеш", который отказался от места в парламенте. В Госдуме вошел во фракцию "Единая Россия".
В последующие годы занимался предпринимательской деятельность. До 2021 г. возглавлял наблюдательный совет ООО "Юг-Нефтепродукт". Был совладельцем компании.
С 2021 г. - депутат Государственной думы РФ VIII созыва. Был избран 19 сентября 2021 г. от партии "Единая Россия" по федеральному округу (баллотировался под пятым номером в региональной группе №39, Московская обл.).