Родился 6 ноября 1977 г. в г. Горьком (ныне Нижний Новгород).
В 1996 г. окончил музыкальное училище по специальностям "солист оркестра" (саксофон-альт), "дирижер эстрадного коллектива", в 2001 г. - филологический факультет Нижегородского государственного университета им. Н. И. Лобачевского по специальности "журналистика".
В 1999-2001 гг. работал старшим редактором нижегородской радиостанции "Радио Рандеву".
С 2001 по 2005 г. - главный советник аппарата полномочного представителя президента РФ в Приволжском федеральном округе Сергея Кириенко.
В 2005-2008 гг. - советник, помощник руководителя Федерального агентства по атомной энергии (Росатом) Сергея Кириенко.
В 2008-2016 гг. занимал должность директора департамента коммуникаций Государственной корпорации по атомной энергии "Росатом", которую в этот период возглавлял Сергей Кириенко.
25 ноября 2016 г. был избран членом совета директоров Всероссийского центра изучения общественного мнения (ВЦИОМ). С 2 декабря 2016 г. по настоящее время – председатель совета директоров ВЦИОМ.
С декабря 2016 г. перешел на работу в Администрацию президента РФ. Работал в должности заместителя начальника управления президента РФ по внутренней политике, которое возглавляет Андрей Ярин. Ранее, 5 октября 2016 г. первым заместителем руководителя Администрации президента РФ стал Сергей Кириенко.
31 января 2017 г. Сергей Новиков был назначен начальником управления президента РФ по общественным проектам. Сменил на этом посту Павла Зеньковича.
Является приглашенным режиссером в Красноярском театре оперы и балета им. Дмитрия Хворостовского.
Ответственный секретарь Российского организационного комитета "Победа".
Награжден медалью ордена "За заслуги перед Отечеством" II степени (2014).
В качестве режиссера-постановщика поставил оперы "Русалка Александра Даргомыжского (Концертный зал им. П. И. Чайковского Московской филармонии, 2016), "Иоланта" Петра Чайковского (московский театр "Геликон-опера", 2019; Шведская королевская опера в Стокгольме, 2021), "Опричник" Петра Чайковского (Михайловский театр Санкт-Петербурга, 2021), "Черевички" Петра Чайковского ("Геликон-опера", 2024).
Владеет английским, французским и итальянским языками.