Родился 20 декабря 1955 г. в Перми.
В 1984 г. окончил экономический факультет Пермского государственного университета им. А. М. Горького (ПГУ; ныне - Пермский государственный национальный исследовательский университет).
В 1973 г. работал фрезеровщиком на Пермском телефонном заводе.
С 1974 по 1977 г. проходил срочную службу на Военно-морском флоте СССР.
С 1978 г. являлся заместителем секретаря комитета комсомола Пермского университета, в 1979-1983 гг. был председателем студенческого профсоюзного комитета ПГУ. Избирался депутатом Дзержинского районного совета народных депутатов Перми.
С 1983 г. - заместитель председателя, в 1988-1992 гг. - председатель Дзержинского райисполкома Перми. С 1990 г. - депутат, член исполкома Пермского городского Совета народных депутатов.
В 1992-1994 гг. - глава администрации Дзержинского района Перми.
С 1994 по 2001 г. - заместитель губернатора Пермской области по вопросам топливно-энергетического комплекса, строительства, жилищно-коммунального хозяйства, транспорта и связи. Регион в этот период возглавляли Борис Кузнецов, Геннадий Игумнов, Юрий Трутнев.
С июля 2001 г. был генеральным директором Пермской региональной компании по реализации газа (ООО "Пермрегионгаз").
В 2001-2005 гг. - депутат Законодательного собрания Пермской области III созыва. 9 декабря 2001 г. избран по избирательному округу №34 (Большесосновский, Оханский, Очёрский, Частинский районы Пермской обл.). Входил в депутатские группы "Единая Россия" и "Промышленники Прикамья", был председателем комитета заксобрания по бюджету и внебюджетным фондам. 22 декабря 2005 г. досрочно сложил с себя депутатские полномочия в связи с назначением на должность исполняющего обязанности главы города Перми.
В 2005-2010 гг. – мэр Перми. В ноябре 2005 г. был утвержден депутатами городской Думы исполняющим обязанности главы города, сменил на этом посту Аркадия Каменева. 12 марта 2006 г. в первом туре выборов мэра Перми набрал 30,32% голосов избирателей, второе место занял Павел Анохин (14,01%). Против всех кандидатов проголосовали 25,23%. Во втором туре Игорь Шубин был избран мэром с результатом 37,13%, Павел Анохин набрал 32,15%. Против всех проголосовали 29,43%.
С 14 декабря 2010 г. по 12 декабря 2011 г. – член Совета Федерации (СФ) РФ. 14 декабря 2010 г. указом губернатора Пермского края Олега Чиркунова был назначен представителем в СФ от исполнительного органа государственной власти региона. Был членом комитета СФ по бюджету (с ноября 2011 г. - по бюджету и финансовым рынкам). 12 декабря 2011 г. полномочия сенатора были досрочно прекращены.
С 4 декабря 2011 г. по 16 февраля 2012 г. - депутат Законодательного собрания Пермского края II созыва. Избран по списку Пермского регионального отделения партии "Единая Россия", возглавлял Очерскую региональную группу №25. Был членом комитета по экономическому развитию и налогам. Досрочно сложил депутатские полномочия в связи с избранием 16 февраля 2012 г. в Совет Федерации РФ.
С 16 февраля 2012 г. по 18 сентября 2016 г. – член Совета Федерации РФ. 16 февраля 2012 г. был наделен полномочиями от законодательного органа государственной власти Пермского края. Был членом комитета СФ по бюджету и финансовым рынкам. 18 сентября 2016 г. полномочия сенатора Игоря Шубина были прекращены досрочно, в связи с его избранием в Государственную думу РФ.
В 2016-2021 гг. – депутат Государственной думы РФ VII созыва. Избран 18 сентября 2016 г. от "Единой России" по Пермскому одномандатному округу №58. Набрал 40,76% голосов избирателей, его ближайший соперник – кандидат от "Справедливой России" Владимир Аликин - 11,30%. В Думе вошел в состав партийной фракции.
С 2021 г. - депутат Государственной думы РФ VIII созыва от "Единой России". Был избран 19 сентября 2021 г. по Пермскому одномандатному избирательному округу №58 (Пермский край). Набрал 30% голосов (второе место в округе заняла директор Чайковской стройкомпании, депутат Чайковского городского округа Олеся Горбунова от КПРФ, 23,2%).
Награжден орденом Дружбы (1998). Отмечен благодарностью правительства РФ (2016).