В целях улучшения экономического развития региона 10 января 2006 г. президент РФ Владимир Путин подписал Федеральный закон "Об Особой экономической зоне в Калининградской области и о внесении изменений в некоторые законодательные акты РФ". Новый закон вступил в силу 1 апреля 2006 г. В ОЭЗ предусмотрен специальный правовой режим ведения инвестиционной и производственной деятельности, включая льготный порядок уплаты налогов на прибыль и имущество организаций и др. В регионе установлен режим свободной таможенной зоны, при котором иностранные товары ввозятся на территорию области и используются на ее территории без уплаты таможенных пошлин и налогов. Товары, произведенные в ОЭЗ и вывозимые в другие страны или ввозимые на остальную часть РФ, также освобождаются от таможенных пошлин и других платежей при таможенном оформлении товаров /кроме таможенных сборов/.
Для того, чтобы стать резидентом /участником/ ОЭЗ необходимо представить инвестиционный проект на сумму не менее 150 млн рублей, не направленный на добычу нефти и газа, производство алкогольной, табачной продукции, топлива. Срок действия ОЭЗ - 25 лет.
7 декабря 2001 г. правительством РФ была утверждена Федеральная целевая программа развития Калининградской области на период до 2010 г. В декабре 2008 г. она была продлена до 2014 г., а в мае 2010 г. - до 2015 г. 15 апреля 2014 г. утверждена Государственная программа РФ "Социально- экономическое развитие Калининградской области до 2020 г.", общий объем ее финансирования из федерального бюджета - 62 млрд 977 млн 488 тыс. 400 рублей.
В госпрограмму вошла и Федеральная целевая программа развития Калининградской области на период до 2015 г. (продлена до 2020 г. постановлением правительства от 7 июня 2014 г.). Общий объем ее финансирования составляет 314 млрд 621 млн 130 тыс. рублей, в том числе: из федерального бюджета - 91 млрд 887 млн 840 тыс., бюджета Калининградской области - 12 млрд 52 млн 290 тыс., из внебюджетных источников - 210 млрд 681 млн рублей.