19 января 2001 г. вертолет Ми-8 Сил воздушной обороны Республики Казахстан (СВО РК), на борту которого находился министр обороны страны, генерал-полковник Сат Токпакбаев, потерпел катастрофу во время посадки близ г. Ленгер (Толебийский район Южно-Казахстанской области). Погиб один из офицеров генерального штаба, сопровождавших министра. Трое членов экипажа и 10 пассажиров получили ранения различной степени тяжести.
14 сентября 2004 г. на военно-учебном полигоне Хлебодаровка (Мартукский район Актюбинской области) во время учебно-тренировочного полета вошел в плоский (неуправляемый) штопор и разбился самолет Як-18. Погибли пилот-инструктор и курсант актюбинского Военного института СВО им. Т.Я. Бегельдинова.
16 февраля 2007 г. в 5 км от аэропорта Сары-Арка (г. Караганда) во время учебного полета потерпел крушение истребитель-перехватчик МиГ-31 СВО РК. Погиб экипаж - командир капитан Денис Федотов и штурман-летчик майор Андрей Леонтьев.
12 февраля 2008 г. на аэродроме Жетыген в Алматинской области учебно-боевой истребитель МиГ-29УБ СВО РК вскоре после взлета разбился из-за отказа двигателей. Один из пилотов погиб.
22 августа 2012 г., выполняя тренировочный полет в районе аэропорта г. Астана, рухнул, разрушился и сгорел вертолет Ми-17 СВО РК. Погиб экипаж из четырех человек. Причиной катастрофы стала ошибка пилотирования - машина попала в режим так называемого "вихревого кольца".
23 апреля 2013 г. в районе с. Просторное (Карагандинская область) во время учебно-тренировочного полета потерпел крушение МиГ-31 (бортовой номер 02) СВО РК под управлением полковника Марата Едигеева и штурмана майора Руслана Галимзянова. Экипаж катапультировался, пилот Едигеев погиб. Причина катастрофы - отказ техники (поломка системы управления стабилизатором).
17 июля 2013 г. на территории военного аэродрома в г. Актобе при заходе на посадку в рамках учебно-тренировочного полета потерпел крушение самолет L-39 Военного института СВО. Погибли инструктор подполковник Евгений Виссарионов и курсант Арман Массалимов. Причина катастрофы - сваливание в результате выхода на закритические углы атаки из-за ошибки пилотирования.
24 сентября 2014 г. министерство обороны Казахстана подтвердило факт крушения военного самолета Су-27 Талдыкорганской авиабазы, который был обнаружен в Коксуском районе в 15 км от села Жаналык.