Андрей Геннадьевич Карлов родился 4 февраля 1954 г. в Москве.
В 1976 г. окончил Московский государственный институт международных отношений (ныне – МГИМО-Университет Министерства иностранных дел РФ), в 1992 г. – Дипломатическую академию МИД СССР (ныне - Дипломатическая академия МИД России). На дипломатической службе находился с 1976 г. Работал на различных должностях в центральном аппарате МИД СССР, МИД РФ и в загранпредставительствах.
В 1976-1981 гг. и в 1984-1990 гг. - сотрудник посольства СССР в Корейской народно-демократической республике (КНДР). В 1992-1997 гг. - сотрудник посольства РФ в Республике Корея. В период с 2001 по 2006 гг. – чрезвычайный и полномочный посол России в КНДР.
С 2007-2008 гг. заместитель директора, а с 26 января 2009 г. по 12 июля 2013 г. - директор Консульского департамента МИД России, член Коллегии МИД.
12 июля 2013 г. г. указом президента РФ Владимира Путина назначен Чрезвычайным и Полномочным Послом Российской Федерации в Турецкой Республике.
19 декабря 2016 г. был убит в результате покушения в Анкаре.
Чрезвычайный и Полномочный Посол (2011) Отмечен благодарностью президента РФ (2011). Владел корейским и английским языками. Был женат. Имел взрослого сына.