В июне 1999 года Фергюсон был посвящен в рыцари в знак признания его заслуг перед английским футболом. Церемония прошла меньше чем через месяц после победы над немецкой "Баварией" в финале Лиги чемпионов (МЮ одержал победу со счетом 2:1, забив оба мяча в компенсированное ко второму тайму время).
В 2011 году одна из трибун домашнего стадиона "Манчестер Юнайтед" была названа в честь Фергюсона - Sir Alex Ferguson End. А в 2012 году рядом со входом на трибуну был открыт памятник тренеру.
По итогам 2011 года был награжден Президентской премией ФИФА. По словам Йозефа Блаттера, возглавлявшего организацию с с 1998 по 2015 год, Фергюсон является олицитворенем мудрости жизни и мудрости футбола.
Кроме того, в 1999 году он стал обладателем медали Муссабини (награда, вручаемая британским тренерам. Названа в честь Сэма Муссабини, который считается первым профессиональным тренером). Также в 2007 и 2008 годах УЕФА называл Фергюсона тренером года. В 2002 году был введен в Зал славы английского футбола, а в 2004-м - в Зал славы шотландского футбола.
