ТАСС-ДОСЬЕ. 30 июня 2022 года МВД России сообщило, что ректору Российской академии народного хозяйства и государственной службы при президенте РФ (РАНХиГС) Владимиру Мау предъявлено обвинение в хищении денежных средств вуза. Он проходит обвиняемым по уголовному делу о мошенничестве в особо крупном размере, ранее возбужденному в отношении бывшего заместителя министра просвещения РФ Марины Раковой и директора Института общественных наук РАНХиГС, ректора Московской высшей школы социальных и экономических наук Сергея Зуева. ТАСС подготовил материал о громких уголовных делах в отношении ректоров федеральных, национальных исследовательских и столичных государственных вузов. За последние 10 лет было шесть таких случаев.
8 марта 2013 года по подозрению в получении взятки в размере 7 млн рублей был арестован ректор Государственного университета управления (Москва) Виктор Козбаненко (возглавлял вуз с 2011 года). По версии следствия, он требовал через доверенных лиц персональное денежное вознаграждение от представителя коммерческой организации за заключение госконтракта на хозобслуживание и уборку территории вуза. Вскоре после возбуждения дела подозреваемый был уволен с поста ректора. Сроки расследования несколько раз продлевались, в сентябре 2014 года Козбаненко был отпущен под подписку о невыезде. В июле 2015 года столичная прокуратура вернула дело в Главное следственное управление Следственного комитета (СК) РФ по Москве на доследование из-за недостаточности доказательств его вины. 19 июня 2017 года Преображенский суд Москвы вынес оправдательный приговор Виктору Козбаненко, следствию так и не удалось доказать факт взятки.
16 июня 2013 года было возбуждено уголовное дело по ст. 286 УК РФ ("Превышение должностных полномочий") в отношении ректора Иркутского государственного технического университета (ныне Иркутский национальный исследовательский технический университет) Ивана Головных (возглавлял вуз с 2000 года). 19 июля 2013 года он был отстранен от должности. Следствие инкриминировало ему незаконную передачу в 2005 году части принадлежащего университету земельного участка под коммерческую застройку одной из строительных фирм Иркутска (материальный ущерб оценивался в более 148 млн рублей). В ноябре 2014 года Головных был также обвинен в незаконном получении завышенной премии по итогам 2010 года. В июле 2015 года Свердловский районный суд Иркутска отправил дело на доследование, выявив доказательство фальсификации материалов. 8 июля 2016 года Свердловский райсуд вынес оправдательный приговор по всем статьям предъявленного обвинения. 22 февраля 2017 года судейская коллегия Иркутского областного суда приняла решение отменить оправдательный приговор и направить уголовное дело на новое судебное разбирательство. 6 августа 2017 года Апелляционный суд Иркутской области оставил принятое постановление о прекращении уголовного дела в силе, не удовлетворив представление прокуратуры. В защиту Ивана Головных выступали академики РАН Евгений Велихов, Михаил Кузьмин, хирург Евгений Григорьев, председатель Совета ректоров Иркутской области Михаил Винокуров.
10 марта 2015 года было возбуждено уголовное дело в отношении ректора Северного (Арктического) федерального университета им. М. В. Ломоносова (САФУ) Елены Кудряшовой (возглавила вуз в 2010 году). Следствие инкриминировало ей злоупотребление должностными полномочиями (ч. 1 ст. 285 УК РФ), подозревая в заключении неправомерного договора на строительство библиотеки вуза с "некомпетентной" московской фирмой. Ущерб государству оценивался в 7 млн рублей. В марте 2015 года Кудряшова сложила с себя полномочия. На время расследования с нее была взята подписка о невыезде. 7 декабря 2015 года уголовное дело было прекращено в связи с отсутствием состава преступления. 26 января 2016 года Кудряшову снова назначили ректором САФУ.
21 марта 2016 года по подозрению в злоупотреблении должностными полномочиями с тяжкими последствиями (ч. 3 ст. 285 УК РФ) был задержан ректор Дальневосточного федерального университета (ДВФУ) Сергей Иванец (возглавлял вуз с 2012 года). 22 марта Ленинский районный суд Владивостока по ходатайству следствия избрал в отношении Иванца меру пресечения в виде домашнего ареста, а 8 июня отпустил его под залог в 1 млн рублей. 8 июля 2016 года суд временно отстранил Иванца от занимаемой должности. Дело было передано в Тихоокеанский флотский военный суд, поскольку в его материалах имелись данные, содержащие гостайну. По данным следствия, в 2011 году между ДВФУ и ООО "Современный университет" был заключен контракт на создание информационно-технической системы вуза на сумму около 650 млн рублей. Система должна была создаваться в несколько этапов и заработать в 2013 году, но этого не произошло. Тем не менее в сентябре 2015 года были составлены и подписаны акты выполнения работ по третьему этапу проекта, и исполнитель получил со счетов ДВФУ свыше 20 млн рублей. До передачи в суд дело было переквалифицировано на ст. 160 УК РФ ("Присвоение или растрата"). 11 ноября 2019 года Тихоокеанский флотский военный суд приговорил Сергея Иванца к 7 годам лишения свободы в колонии общего режима и выплате штрафа в размере 500 тыс. рублей.
21 апреля 2020 года следственные органы Следственного комитета РФ по Республике Татарстан возбудили уголовное дело в отношении ректора Казанского национального исследовательского технологического университета (КНИТУ) Сергея Юшко (возглавлял вуз с июня 2017 года) по подозрению в совершении преступлений, предусмотренных ч. 4 ст. 159 ("Мошенничество") и ч. 2 ст. 292 ("Служебный подлог") УК РФ. 28 апреля он был задержан и 30 апреля решением Советского районного суда Казани помещен под домашний арест. 27 мая 2020 года приказом Министерства науки и высшего образования РФ его временно отстранили от должности ректора (на период производства по уголовному делу до его прекращения либо до вступления в силу приговора суда). По версии следствия, в 2004-2017 годах (еще до своего ректорства) Юшко, трудясь в режиме полной занятости в инновационно-производственном технопарке "Идея", одновременно числился заведующим кафедры инженерной и компьютерной графики, а также деканом факультета инновационных технологий КНИТУ (также на условиях полной занятости). Следствие установило, что фактически данного деканата не существовало, а его функции выполняло другое подразделение в качестве дополнительной нагрузки. Более того, как представитель технопарка "Идея" он заключил с КНИТУ договор, связанный с повышением квалификации сотрудников. Однако из 1,3 млн рублей по договору было потрачено 129 тыс. Весной 2021 года прокуратура Татарстана сочла дело не готовым для передачи в суд, и оно было возвращено следователям. Тогда же Сергею Юшко изменили меру пресечения с домашнего ареста на подписку о невыезде. С августа 2021 года дело Юшко рассматривается в Вахитовском районном суде Казани. Общий ущерб, который ему вменяют, оценивается обвинением в 11 млн рублей.
22 декабря 2021 года стало известно о задержании в Казани правоохранительными органами ректора Казанского федерального университета (КФУ) Ильшата Гафурова (возглавлял вуз с 2010 года) по подозрению в возможной причастности к убийству, совершенном несколько лет назад. В тот же день он был доставлен в Москву и заключен под стражу по решению Басманного суда столицы, который удовлетворил ходатайство следствия об аресте Гафурова по делу, возбужденному по ч. 2 cт. 105 УК РФ ("Убийство, совершенное группой лиц по предварительному сговору по найму"). 22 декабря 2021 г. Минобрнауки РФ временно отстранило его от должности ректора КФУ, а с 21 марта 2022 года расторгло с ним трудовой договор. С марта 2022 года Ильшат Гафуров находится в СИЗО г. Тольятти, куда его этапировали из Москвы. Он обвиняется в подстрекательстве к убийству по найму.