Сергей Дмитриевич Шаталов родился 2 января 1950 г. в г. Пскове.
В 1972 г. окончил Ленинградский государственный университет им. А.А. Жданова (ныне Санкт-Петербургский государственный университет) по специальности "математик", в 1981 г. - аспирантуру Ленинградского политехнического института (ныне Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого).
Кандидат физико-математических наук (1981).
Доктор экономических наук. В 2003 г. в Академии народного хозяйства при правительстве РФ защитил диссертацию на тему "Методология формирования и развития налоговой системы Российской Федерации".
С 1973 г. по 1990 г. преподавал на кафедрах теоретической механики и высшей математики в Псковском филиале Ленинградского политехнического института, занимал должности ассистента, затем старшего преподавателя, с 1981 г. - доцента.
В 1990-1993 гг. - народный депутат РСФСР (с 25 декабря 1991 г. - РФ). 4 марта 1990 г. избран от Псковской области. Возглавлял подкомиссию Верховного Совета РСФСР по налоговой политике, был секретарем комиссии Совета Республики по бюджету, планам, налогам и ценам. Входил в парламентские фракции "Смена-Новая политика" и "Демократическая Россия".
С 1993 г. по 1995 г. был директором налогового департамента акционерного общества "Центр по иностранным инвестициям и приватизации".
С 15 апреля 1995 г. по 6 января 1998 г. - заместитель министра финансов РФ, занимался разработкой проекта Налогового кодекса. Пост министра финансов в это время последовательно занимали Владимир Пансков и Александр Лившиц. Уволен по собственной просьбе.
В 1998-2000 гг. возглавлял управление налогообложения Московского филиала транснациональной корпорации PriceWaterhouseCoopers.
С 2000 г. по 2016 г. работал в правительстве РФ. С 19 января 2000 г. - первый заместитель министра финансов РФ Михаила Касьянова. С 20 марта 2001 г. исполнял обязанности, с 8 февраля 2002 г. по 9 апреля 2004 г. являлся статс- секретарем - первым заместителем министра финансов РФ Алексея Кудрина. Курировал страховой и налоговый департаменты министерства, руководил разработкой 2-й части Налогового кодекса РФ, был членом коллегии Министерства по налогам и сборам.
С 9 апреля 2004 г. заместитель, с 27 октября 2005 г. по 27 июня 2013 г. статс-секретарь-заместитель министра финансов РФ. Ведомство в этот период последовательно возглавляли Алексей Кудрин и Антон Силуанов.
С 27 июня 2013 г. - заместитель министра финансов РФ Антона Силуанова.
Общая сумма декларированного годового дохода за 2014 г. составила 43 млн 431 тыс. 192 руб., у супруги доходов не задекларировано.
Действительный государственный советник РФ 1-го класса (2001).
Награжден орденами Дружбы (2013), "За заслуги перед Отечеством" IV (2007) степени, медалями "Защитнику свободной России" (1997) и П.А. Столыпина I степени (2015). Также имеет орден Дружбы народов (Белоруссия; 2009). Отмечен Почетной грамотой (2010) и дважды - благодарностью президента РФ (2001, 2012). Кроме того удостоен Почетной грамотой (2004) и двумя благодарностями правительства РФ (2000, 2001).
Заслуженный экономист РФ (2002).
Автор книги "Развитие налоговой системы России. Проблемы, пути решения и перспективы" (2000), комментариев к Налоговому кодексу РФ.
Женат, имеет сына и дочь.
