Родился 28 мая 1951 г. в селе Суерка Упоровского района Тюменской обл.
В 1973 г. окончил Тюменский индустриальный институт (ныне Тюменский индустриальный университет) по специальности "Бурение нефтяных и газовых скважин". В 1990 г. стал выпускником московской Академии народного хозяйства при Совете министров СССР (ныне в составе Российской академии народного хозяйства и государственной службы при президенте РФ) по специальности "Экономика, организация управления и планирования народного хозяйства".
Доктор экономических наук. Кандидатскую диссертацию на тему "Оценка экономической эффективности инновационной стратегии нефтяной компании: на примере ОАО "Сургутнефтегаз" защитил в 2000 г. в Санкт-Петербургском государственном горном институте (ныне Санкт-Петербургский горный университет). Докторскую диссертацию на тему "Эффективность устойчивого развития нефтегазовой компании в условиях реформирования ТЭК России" защитил там же в 2003 г.
Начал работать в 1973 г. помощником бурильщика Нижневартовского управления буровых работ.
В 1976 г. был переведен из Нижневартовска в Сургут и назначен главным инженером Сургутского управления буровых работ №2 производственного объединения (ПО) "Сургутнефтегаз".
С 1978 г. занимал должность заместителя генерального директора - начальника управления по бурению ПО "Юганскнефтегаз" Главтюменнефтегаза Министерства нефтяной промышленности СССР.
В период с 1980 по 1983 г. работал заместителем генерального директора – начальником управления по бурению ПО "Сургутнефтегаз".
В 1983-1984 гг. - заместитель начальника Главного Тюменского производственного управления по нефтяной и газовой промышленности по бурению Министерства нефтяной промышленности СССР.
В июле 1984 г. был назначен генеральным директором ПО "Сургутнефтегаз". С 1993 г. - генеральный директор ОАО "Сургутнефтегаз" (ныне ПАО). В апреле 2021 г. в очередной раз был переназначен на этот пост советом директоров компании на пятилетний срок. Также Владимир Богданов занимает пост заместителя председателя совета директоров "Сургутнефтегаза". Возглавляет советы директоров ряда дочерних предприятий компании.
В апреле 2018 г. против Владимира Богданова были введены персональные санкции США в рамках закона "О противодействии противникам Америки посредством санкций" (Countering America’s Adversaries Through Sanctions Act, CAATSA).
В 1994-1997 гг. был депутатом Тюменской областной думы первого созыва.
В 2010-2012 гг. - председатель совета директоров Сургутнефтегазбанка.
С 2001 г. Владимир Богданов входит в список миллиардеров по версии американского журнала Forbes. В 2016 г. занимал в рейтинге 1067-е место с состоянием в 1,7 млрд долларов США, при этом выше всего в этом списке он находился в 2006 г. (158-е место, 4,1 млрд долларов). В рейтинге, опубликованном в апреле 2021 г., занимает 1750-е место в мире и 76-е - в России с состоянием в 1,8 млрд долларов.
По состоянию на конец 2020 г. владел 0,3028% акций ОАО "Сургутнефтегаз".
Герой Труда Российской Федерации (2016, "за особые трудовые заслуги перед государством и народом"). Награжден орденами "Знак Почета" (1981), Трудового Красного Знамени (1986), Почета (2010), "За заслуги перед Отечеством" II (2006), III (2001) и IV (1997) степеней, медалью "За освоение недр и развитие нефтегазового комплекса Западной Сибири" (1984), Почетной грамотой (2011) и благодарностями (2007, 2012) президента РФ. Удостоен белорусского ордена Почета (2001).
Заслуженный работник нефтяной и газовой промышленности РФ (1993).
Почетный гражданин Ленинградской обл., Ханты-Мансийского автономного округа - Югры, г. Сургута и Сургутского района.
Женат, дочь.