Родился 7 марта 1975 г. в г. Выборге Ленинградской области.
В 1998 г. окончил Северо-Западную академию государственной службы Российской академии государственной службы при президенте РФ (ныне в составе Российской академии государственной службы и народного хозяйства при президенте РФ) по специальности "государственное и муниципальное управление".
В 1993 г. работал на заводе "Электроинструмент", в 1996-1997 гг. - на АОЗТ "Сервистур" (г. Выборг).
В 2000 г. вступил в партию "Единство" (с 2003 г. – "Единая Россия"). В том же году стал первым заместителем председателя отделения движения "Молодежное единство" в Ленинградской области.
Занимался предпринимательской деятельностью.
В 2001-2005 гг. - депутат муниципального собрания Выборгского района Ленинградской области.
С октября 2005 г. по октябрь 2009 г. - депутат совета Выборгского городского поселения.
С 2006 по 2010 г. был председателем общественной молодежной палаты при Законодательном собрании Ленинградской области.
В 2007-2010 гг. - заместитель, затем первый заместитель руководителя исполкома ленинградского областного регионального отделения партии "Единая Россия".
В 2010-2017 гг. работал в Администрации президента РФ. С марта 2010 г. Михаил Ведерников был советником департамента региональной политики Управления президента РФ по внутренней политике, с февраля 2012 г. - начальником департамента по работе с регионами Южного и Северо-Кавказского федеральных округов того же управления.
В декабре 2012 г. был назначен заместителем полномочного представителя президента РФ в Северо-Кавказском федеральном округе.
С февраля по октябрь 2017 г. занимал должность заместителя полномочного представителя президента РФ в Северо-Западном федеральном округе.
С 2017 г. руководит Псковской областью.
12 октября 2017 г. указом главы государства был назначен врио губернатора Псковской области (сменил на этом посту Андрея Турчака).
9 сентября 2018 г. Михаил Ведерников был избран губернатором Псковской области (баллотировался от партии "Единая Россия"), получив 70,68% голосов избирателей. Второе место занял уполномоченный по защите прав предпринимателей в Псковской области Аркадий Мурылев от КПРФ (13,83%). 17 сентября того же года Михаил Ведерников официально вступил в должность.
10 сентября 2023 г. вновь победил на выборах губернатора Псковской области с результатом 86,30% голосов (был выдвинут "Единой Россией"). Его ближайший соперник, депутат регионального парламента, первый секретарь областного отделения КПРФ Петр Алексеенко, набрал 6,22%. Инаугурация Михаила Ведерникова прошла 27 сентября того же года.
Член Государственного совета РФ.
Действительный государственный советник РФ II класса (2013).
Награжден медалью ордена "За заслуги перед Отечеством" II степени (2020). Имеет Почетную грамоту (2016) и благодарности президента РФ (2012, 2018 и 2019).
Награжден орденом Преподобного Сергия Радонежского III степени (РПЦ; 2023). Имеет наградное оружие.