Родился 28 февраля 1955 г. в г. Франкфурте-на-Одере (Германия) в семье военнослужащего.
Образование, ученые степени и звания
В 1978 г. окончил Московский институт инженеров железнодорожного транспорта (ныне Российский университет транспорта) по специальности "строительство железных дорог, путь и путевое хозяйство", в 1992 г. - Академию народного хозяйства при правительстве РФ (ныне Российская академия народного хозяйства и государственной службы при президенте РФ) по специальности "ведущий специалист управления".
Доктор экономических наук. В 1992 г. в Научно-исследовательском институте экономики и организации материально-технического снабжения защитил кандидатскую диссертацию по теме "Организация обеспечения материальными ресурсами и развитие торговой инфраструктуры агропромышленного комплекса". В 2000 г. во Всероссийском научно-исследовательском институте экономики, труда и управления в сельском хозяйстве защитил докторскую диссертацию по теме "Продовольственное обеспечение России (проблемы и механизмы их решения)".
Был академиком Российской академии сельскохозяйственных наук. Академик Российской академии наук (2013).
Деятельность в 1980-1990-х годах
В 1978-1980 гг. проходил срочную военную службу в железнодорожных войсках в Хабаровском крае.
В 1980-1981 гг. - старший прораб строительного управления №4 ремонтно-строительного треста Москворецкого района Москвы.
С 1981 по 1986 г. работал в Министерстве плодоовощного хозяйства РСФСР главным специалистом, начальником отдела, заместителем начальника главного управления материально-технического снабжения (Главснаба).
В 1986 г. занимал должность заместителя начальника управления производства и распределения тары Государственного агропромышленного комитета РСФСР.
С 1986 по 1992 г. - заместитель генерального директора по материально-техническому снабжению агропромышленного комбината (АПК) "Москва". С 1989 г. был председателем, затем генеральным директором производственно-технического объединения "Агропромсервис" АПК "Москва".
В 1992-1997 гг. занимал должность заместителя главы администрации – начальника управления сельского хозяйства Люберецкого района Московской области.
В правительстве РФ в 1990-х годах
В 1997-1998 гг. Алексей Гордеев руководил департаментом экономики Министерства сельского хозяйства и продовольствия РФ.
С 25 мая 1998 г. по 19 августа 1999 г. - первый заместитель министра сельского хозяйства и продовольствия РФ.
19 августа 1999 г. был назначен министром сельского хозяйства и продовольствия РФ. Затем, с 20 мая 2000 г., занимал пост заместителя председателя правительства РФ - министра сельского хозяйства. С 9 марта 2004 г. по 26 февраля 2009 г. - министр сельского хозяйства РФ.
Возглавлял наблюдательный совет Россельхозбанка, совет директоров ОАО "Росагролизинг" (2000-2008).
Губернатор Воронежской области
В 2009-2017 гг. – губернатор Воронежской области.
16 февраля 2009 г. президент России Дмитрий Медведев внес в Воронежскую областную думу кандидатуру министра сельского хозяйства РФ Алексея Гордеева для наделения его полномочиями губернатора региона. 26 февраля 2009 г. депутаты облдумы утвердили Алексея Гордеева в должности (за - 48 из 52). 12 марта того же года он принял присягу.
7 марта 2014 г. в связи с истечением срока полномочий Алексея Гордеева на посту главы Воронежской области президент РФ Владимир Путин назначил его врио губернатора региона.
14 сентября 2014 г. Алексей Гордеев был избран губернатором Воронежской области на прямых выборах. Баллотировался от партии "Единая Россия". По итогам голосования получил 88,81% голосов избирателей (второе место занял кандидат от КПРФ Константин Ашифин, 7,65%). 20 сентября 2014 г. Алексей Гордеев вступил в должность. Занимал ее до 2017 г.
В Администрации президента РФ и правительстве
С 25 декабря 2017 г. по 18 мая 2018 г. - полномочный представитель президента РФ в Центральном федеральном округе (сменил на этом посту Александра Беглова).
С 2017 по 2018 г. - член Совета безопасности РФ.
С 18 мая 2018 г. по 21 января 2020 г. был заместителем председателя правительства РФ Дмитрия Медведева. Курировал вопросы, связанные с развитием сельского хозяйства, агропромышленного комплекса, биотехнологий и рыболовства, лесного хозяйства и лесопромышленного комплекса, природопользования, охраны окружающей среды и экологического надзора, а также выполнение национального проекта в сфере экологии.
Входил в состав Совета при президенте РФ по стратегическому развитию и национальным проектам, а также в его президиум. С 2018 г. возглавлял Совет по развитию лесного комплекса при правительстве РФ, Комиссию правительства по вопросам развития рыбохозяйственного комплекса.
Партийная и общественная деятельность
В 1999-2003 гг. - заместитель председателя Аграрной партии России (лидер - Михаил Лапшин).
В 2002-2011 гг. - председатель Российского аграрного движения.
В 2003 г. вошел в высший совет партии "Единая Россия".
В декабре 2005 г. вступил в "Единую Россию".
Председатель общественного совета федерального партийного проекта "Чистая страна".
Был президентом Национального союза дзюдо (с 2003 г.), президентом Федерации дзюдо России (2004-2009).
В Государственной думе
В 2007, 2011 и 2016 гг. баллотировался в Государственную думу V, VI и VII созывов по федеральному округу в составе списка кандидатов от партии "Единая Россия". На выборах 2 декабря 2007 г. возглавлял региональную группу №65 (Рязанская область), на выборах 4 декабря 2011 г. - региональную группу №39 (Воронежская область), на выборах 18 сентября 2016 г. - региональную группу №24 (Владимирская, Воронежская, Липецкая, Рязанская области). После прохождения в парламент от депутатского мандата отказывался.
В 2020-2021 гг. - депутат Государственной думы VII созыва. 12 февраля 2020 г. Алексею Гордееву был передан мандат члена фракции "Единая Россия", ставший вакантным после ухода из Госдумы Геннадия Кулика. С 13 февраля 2020 г. был заместителем председателя Государственной думы VII созыва Вячеслава Володина (сменил на посту руководителя фракции "Единая Россия" Сергея Неверова).
С 2021 г. - депутат Государственной думы VIII созыва. Был избран 19 сентября 2021 г. от "Единой России" по Павловскому одномандатному избирательному округу №90 (Воронежская область). На выборах получил 72,01% голосов избирателей (второе место в округе занял кандидат от КПРФ Денис Рослик, 12,49%).
С 12 октября 2021 г. - заместитель председателя Государственной думы VIII созыва Вячеслава Володина.
16 января 2024 г. возглавил рабочую группу Госдумы, созданную для решения проблем в жилищно-коммунальном хозяйстве.
Звания, награды, книги
Действительный государственный советник РФ I класса (1999).
Награжден орденом "За заслуги перед Отечеством" I, III, IV (2025, 2005, 2008) степеней, орденами Почета (2001), Александра Невского (2015), медалью ордена "За заслуги перед Отечеством" II степени (1997), медалью П. А. Столыпина I степени (2009). Дважды отмечен благодарностью президента РФ (2003, 2007), имеет Почетную грамоту правительства РФ (2005).
Заслуженный экономист РФ (1999), заслуженный работник сельского хозяйства РФ (2009).
Почетный гражданин Воронежской области (2017).
Автор учебников "Россия - зерновая держава" (2009), "Российское зерно - стратегический товар XXI века" (2007).