Родился 18 февраля 1974 г. в Сочи (Краснодарский край) в семье Александра Никодимовича и Валентины Федоровны Кафельниковых. Отец в молодости был волейболистом, затем работал водителем такси.
Выпускник кафедры теории и методики спортивных игр Кубанской государственной академии физической культуры (ныне - Кубанский государственный университет физической культуры, спорта и туризма, Краснодар).
Теннисная карьера
В 1979 г. Евгений Кафельников начал заниматься в теннисной секции в родном городе. Первым тренером был Валерий Песчанко. С июня 1979 г. по осень 1991 г. занимался под руководством Валерия Шишкина.
Во второй половине 1980-х гг. Евгений Кафельников принимал участие во всесоюзных и международных теннисных соревнованиях среди юношей.
В 1989 г. стал чемпионом СССР среди юношей в одиночном разряде.
В 1989 и 1990 гг. в составе сборной СССР выигрывал Кубок мира среди теннисистов в возрасте до 16 лет.
В 1991 г. Евгений Кафельников прошел стажировку в теннисной академии Ника Боллетьери (США). С 1991 по 1998 г. его наставником был заслуженный тренер СССР Анатолий Лепешин.
В 1992 г. Евгений Кафельников получил статус профессионала. 27 июля того же года он дебютировал на турнире Ассоциации теннисистов-профессионалов (Association of Tennis Professionals, ATP) в Сан-Марино, уступив в первом круге Рональду Аженору (Гаити). 9 ноября россиянин одержал первую победу в ATP-туре, в первом круге "Кубка Кремля" (Москва) обыграв испанца Маркоса Горрица.
10 января 1994 г. Евгений Кафельников выиграл первый в профессиональной карьере титул в одиночном разряде, одержав верх над соотечественником Александром Волковым в финале турнира в Аделаиде (Австралия).
11 апреля 1994 г. завоевал первый в профессиональной карьере титул в парном разряде вместе с чехом Давидом Риклом. В финале турнира в Барселоне (Испания) спортсмены нанесли поражение американцу Джиму Курье и испанцу Хавьеру Санчесу.
10 июня 1996 г. Евгений Кафельников выиграл Открытый чемпионат Франции ("Ролан Гаррос"), став первым россиянином - победителем турнира Большого шлема в одиночном разряде. В решающем поединке он переиграл немца Михаэля Штиха. Тогда же в паре с чехом Даниэлем Вацеком он стал победителем парного разряда Открытого чемпионата Франции. В финале они нанесли поражение швейцарцу Якобу Хласеку и французу Ги Форже. В 1997 (вместе с Даниэлем Вацеком) и 2002 (вместе с голландцем Паулем Хархейсом) гг. Евгений Кафельников вновь становился победителем "Ролан Гаррос". В 1997 г. вместе с Даниэлем Вацеком он также выиграл соревнования в парном разряде на другом турнире Большого шлема - Открытом чемпионате США.
С 1998 г. Евгений Кафельников тренировался под руководством американского специалиста Ларри Стефанки.
1 февраля 1999 г. стал победителем Открытого чемпионата Австралии в одиночном разряде. В финале этого турнира Большого шлема он нанес поражение шведу Томасу Энквисту.
С 3 мая по 13 июня 1999 г. Евгений Кафельников возглавлял рейтинг-лист ATP. Стал первым россиянином, достигшим его верхней строчки.
В октябре 2000 г. в Сиднее (Австралия) Евгений Кафельников стал чемпионом теннисного турнира в рамках XXVII летних Олимпийских игр. В финальном матче он победил немца Томми Хааса. Является единственным спортсменом в истории отечественного мужского тенниса, ставшим олимпийским чемпионом в одиночном разряде.
В декабре 2002 г. Евгений Кафельников вместе с Михаилом Южным, Маратом Сафиным и Андреем Столяровым в составе сборной России стал обладателем Кубка Дэвиса. В состоявшемся в Париже финале отечественные теннисисты нанесли поражение французам со счетом 3:2.
Евгений Кафельников завершил карьеру в 2003 г. В общей сложности он провел 1486 матчей в одиночном и парном разрядах, в которых одержал 967 побед. Спортсмен завоевал 26 титулов в одиночном разряде (в т. ч. в 1997-2001 гг. пять раз подряд выиграл "Кубок Кремля") и 27 - в парном. За годы выступлений он заработал более 23,8 млн долларов призовых. Впоследствии участвовал в турнирах ветеранов тенниса.
Деятельность после окончания теннисной карьеры
После окончания карьеры Евгений Кафельников профессионально занимался гольфом. В 2011 г. он стал чемпионом России. Также принимал участие в покерных турнирах.
С 2012 г. по н. в. является вице-президентом Федерации тенниса России.
Евгений Кафельников входил в состав Совета при президенте РФ по физической культуре и спорту, занимал пост вице-президента Ассоциации гольфа России.
Соучредитель и генеральный директор ООО "Гольф профи тур".
Заслуженный мастер спорта РФ по теннису (1996). Мастер спорта РФ по гольфу (2012).
Награжден орденом Почета (2001).
С 2011 г. Евгений Кафельников несколько раз входил в число претендентов на введение в Международный зал теннисной славы (Ньюпорт, шт. Род-Айленд, США). 21 января 2019 г. стало известно, что спортсмен включен в него. Официальная церемония состоялась в Ньюпорте 20 июля 2019 г.
Разведен. В 1998-2001 гг. был женат на Марии Тишковой. Дочь - Алеся (род. 1998, студентка Высшей школы кино и телевидения "Останкино").