Родился 4 октября 1965 г. в Новороссийске (Краснодарский край). Его отец был инженером, мать - архивистом.
В 1982 г. Евгений Касперский окончил математическую школу-интернат №18 им. Колмогорова при Московском государственном университете (МГУ) им. М.В. Ломоносова. В 1991 г. стал выпускником факультета криптографии, связи и информатики (4-й технический факультет) при Высшей школе КГБ (ныне - Академия ФСБ России), специальность - "инженер-математик".
С 1987 г. работал в научно-исследовательских институтах при Минобороны СССР, с 1989 г. стал изучать компьютерные вирусы.
В 1990 г. занялся разработкой антивирусного программного обеспечения при научно-техническом центре "КАМИ" в Москве. С 1994 г. это компьютерное приложение получило название AVP ("AntiViral Toolkit Pro", англ. "профессиональный антивирусный инструментарий"). К 1997 г. программа начала успешно выходить на международный рынок и заключила договоры о ее поставках с рядом иностранных фирм. После этого Касперский ушел из "КАМИ" и 26 января 1997 г. основал собственную фирму - "Лаборатория Касперского", продолжившую выпускать антивирус. В 2000 г. AVP был переименован в "Антивирус Касперского". Впоследствии "Лаборатория" занялась комплексом программ для информационной безопасности, в настоящее время она является одной из крупнейших мировых компаний в данной области.
В 2003 г. вместе с бывшей женой Натальей основал компанию по корпоративной кибербезопасности Infowatch. После окончательного раздела бизнеса бывших супругов в 2007 г., Infowatch отошел Наталье Касперской.
С 12 декабря 2022 г. - член экспертного совета при правительстве РФ.
С 2007 г. Евгений Касперский является генеральным директором "Лаборатории Касперского". В 2015 г. журнал Forbes впервые включил Касперского в свой список миллиардеров мира, поместив его на 1741-е место с состоянием в $1 млрд. В 2025 г. он занимает 2203-е место в мире и 82-е в России с $1,7 млрд.
За крупные достижения в сфере современных систем защиты компьютерной информации в 2009 г. награжден Государственной премией РФ в области науки и технологий. Лауреат многочисленных премий и наград в компьютерной сфере.
Автор пяти книг, из них только одна ("Компьютерные вирусы в MS-DOS") касается его профессиональных интересов, остальные посвящены путешествиям.
Увлекается путешествиями, фотографией и альпинизмом.
Увлекается путешествиями, фотографией и альпинизмом.