Родился 14 марта 1963 г. в г. Ленинграде (ныне – Санкт-Петербург).
В 1985 г. окончил юридический факультет Ленинградского государственного университета им. А.А. Жданова (ЛГУ; ныне – Санкт-Петербургский государственный университет - СПбГУ).
Кандидат юридических наук. В 1989 г. в ЛГУ защитил диссертацию по теме "Обязательство по оказанию услуг в советском гражданском праве".
В 1986-2005 гг. – на преподавательской работе в ЛГУ (СПбГУ). С 1993 г. доцент кафедры гражданского права, с 2000 г. – заведующий кафедрой правовой охраны окружающей среды, проректор СПбГУ по правовым и экономическим вопросам.
В 1992 г. вместе с преподавателем юридического факультета СПбГУ Николаем Кропачевым зарегистрировал в Комитете внешних связей мэрии Санкт-Петербурга, который возглавлял Владимир Путин, компании RMN-FRITERM и "РОШ-Петербург". Возглавил фирму "РОШ-Петербург".
В 1995 г. компания "РОШ-Петербург" приобрела долю в акционерном обществе открытого типа "Балтийское Морское Пароходство" ("БМП"). Михаил Кротов стал заместителем председателя, затем председателем совета директоров "БМП".
С февраля по ноябрь 2005 г. занимал должность первого заместителя генерального директора открытого акционерного общества "Газпром-Медиа" (руководитель – Николай Сенкевич).
С 7 ноября 2005 г. работал в Администрации президента РФ, где до 31 января 2020 г. занимал должность полномочного представителя главы государства в Конституционном Суде Российской Федерации (пост главы государства в этот период занимали Владимир Путин и Дмитрий Медведев). Сменил на этом посту Михаила Митюкова.
С 24 июля 2020 г. - судья Верховного суда РФ.
Согласно опубликованной декларации о доходах и расходах, в 2013 г. заработал 8 млн 346 тыс. рублей, супруга – 360 тыс. рублей.
Общая сумма декларированного годового дохода за 2014 г. составила 8 млн 571 тыс. руб., супруги – 297 тыс. руб.
Общая сумма декларированного годового дохода за 2015 г. составила 8 млн 105 тыс. руб., супруги – 607 тыс. руб.
Общая сумма декларированного годового дохода за 2016 г. составила 7 млн 187 тыс. руб., у супруги, согласно декларации, доходов не было.
Общая сумма декларированного годового дохода за 2017 г. составила 7 млн 138 тыс. руб., у супруги, согласно декларации, доходов не было.
Общая сумма декларированного годового дохода за 2018 г. составила 8 млн 181 тыс. руб., у супруги - 206 тыс. руб.
Действительный государственный советник РФ I класса (2006).
Лауреат премии президента Российской Федерации в области образования за 2001 год, премии правительства РФ в области образования за 2007 год.
Награжден орденами Почета (2008), Дружбы (2012), Александра Невского (2016).
Заслуженный юрист РФ (2010), почетный работник высшего профессионального образования.
Также среди наград - медаль А.Ф. Кони Министерства юстиции РФ (1999).
Профессор кафедры гражданского права Факультета права Национального исследовательского университета "Высшая школа экономики" (НИУ ВШЭ). Работает в НИУ ВШЭ с 2007 г.
Автор более 35 научных публикаций по гражданскому и морскому праву. Соавтор учебника "Гражданское право", комментариев к Гражданскому и Трудовому кодексам РФ.
Владеет английским языком.
Женат, имеет двух сыновей.