Родился 1 августа 1951 г. в деревушке Марей-сюр-Ле-Диссе на атлантическом побережье Франции.
Учился в частных школах Реймса, Парижа и Нёйи-сюр-Сен. В 1974 г. окончил Высшую коммерческую школу в Париже (ESCP Europe).
По окончании учебы начал работать в нефтяном концерне Total. Сначала работал в финансовом департаменте компании, затем в отделениях по Африке, Северной Америке.
В 1992 г. начал работу в ближневосточном отделении Tolal, где отвечал за торговлю в этом регионе, в 1995 г. стал главой отделения. Под его руководством Tolal утвердилась как компания, несущая в ближневосточные страны западный капитал и технологии, но при этом отстаивающая интересы Франции, а не США и Великобритании. Так многомиллиардные инвестиции в Катар в середине 1990-х годов предотвратили экономическую катастрофу эмирата. О себе и своей работе в этот период, де Маржери говорил - "я "вылупился" именно в этот период". Он был хорошим дипломатом, мог найти общий язык как с российскими главами нефтяных компаний, так и с нефтяными магнатами стран персидского залива.
В мае 1999 г. был назначен руководителем подразделения по разведке и добыче углеводородов и вошел в состав исполнительного комитета Total.
В 2000 г. занял должность заместителя генерального директора подразделения по разведке и добыче вновь образованного концерна TotalFinaELF, в январе 2002 г. – генеральный директор подразделения по разведке и добыче концерна Total. Под его руководством расширилась география деятельности компании - углубилось сотрудничество с Россией, с Саудовской Аравией, компания стала участвовать в разработках нефтяных песков в Канаде.
В мае 2006 г. стал членом совета директоров, в феврале 2007 г. - генеральным директором Total, а в мае 2010 г. - президентом-генеральным директором компании. Хотя в эти годы Total уже была лидером нефтяной индустрии, де Маржери удалось заключить очень перспективные контракты на бурение нефтяных скважин в Иракском Курдистане, Мьянме, Катаре и России.
В 2006 г. против де Маржери были выдвинуты обвинения в незаконных финансовых операциях и превышении полномочий в 1996-2003 гг. при реализации программы ООН в Ираке "Нефть в обмен на продовольствие", а также при оформлении контракта между Total и иранской нефтяной компанией на разработку месторождения Южный Парс. Расследование шло восемь лет. В 2013 г. обвинения были сняты.
В мае 2014 г. Кристоф де Маржери посетил Петербургский экономический форум, который многие западные лидеры проигнорировали в связи с санкциями в отношении России, введенными в связи с событиями на Украине. Де Маржери тогда заявил, что "Total работает в России уже 20 лет и не намерен сворачивать свою деятельность". Кроме того, де Маржери считал, что залогом успешного сотрудничества является уважение чужой культуры, а не столкновение цивилизаций. Такой позиции он придерживался и в вопросе сотрудничества с Россией.
В октябре 2014 г. в Москве де Маржери принимал участие в заседании французско-российской консультативной группы по иностранным инвестициям, в ходе которого провел переговоры с председателем правительства РФ Дмитрием Медведевым. По словам министра экономического развития Алексея Улюкаева, французская сторона подтвердила готовность работать в России "в любых условиях с точки зрения геополитики и экономических обстоятельств". Де Маржери говорил об этом всегда и призывал "не строить новых берлинских стен".
Кристоф де Маржери погиб 20 октября 2014 г. в результате авиакатастрофы в московском аэропорту Внуково. Похоронен 28 октября на кладбище г. Сен-Пер-сюр-Мер (департамент Манш, Нормандия) в фамильном склепе, который семья приобрела в 2000 г. В последний путь Кристофа де Маржери проводили только близкие родственники.
Среди профессиональных качеств Кристофа де Маржери коллеги отмечали его умение вести переговоры. Французские СМИ называли его "капитаном промышленности" и "послом Франции".
В телеграмме соболезнования президенту Франции Франсуа Олланду президент РФ Владимир Путин назвал Кристофа де Маржери "большим другом нашей страны".
Кавалер французского ордена "За заслуги" (Ordre National du Mérite).
22 октября 2014 г. посмертно присвоено звание офицера ордена Почетного легиона (Ordre National de la Légion d'Нonneur), 1 ноября за большой вклад в развитие российско-французских экономических и культурных связей награжден российским орденом Почета.
Вдова - Бернадетт (Bernadette), вице-президент неправительственной организации помощи сиротам. Дочери - Летиция (Laëtitiа) и Диана (Diane), сын - Фабрис (Fabrice).
Увлекался картингом. За любовь к хорошим винам и вкусной еде его называли гедонистом.