Родился 12 ноября 1960 г. в пос. Семхоз Загорского (ныне Сергиево-Посадского) района Московской области.
В 1978-1980 гг. учился в Московском институте нефтехимической и газовой промышленности им. И. М. Губкина (ныне Российский государственный университет нефти и газа имени И. М. Губкина) по специальности "промышленная теплоэнергетика". Обучение не закончил. Позднее прошел профессиональную переподготовку в этом вузе по программе "Экономика и управление на предприятиях нефтегазового комплекса".
В 1987 г. получил диплом Московского государственного университета культуры по специальности "режиссура". Затем окончил Российскую академию государственной службы при президенте РФ (ныне Российская академия народного хозяйства и государственной службы при президенте РФ; РАНХиГС) по специальности "юриспруденция".
В 2001 г. в Московском государственном университете культуры и искусства защитил диссертацию на соискание степени кандидата философских наук по теме "Ценностные ориентации личности в контексте взаимовлияния религии и других феноменов духовной культуры".
Доктор философских наук. В 2013 г. в РАНХиГС защитил диссертацию на тему "Лидерство как организационный феномен: взаимосвязь социальных и личностных аспектов: социально-философский анализ".
В детстве сыграл главную роль в художественном фильме "Денискины рассказы" (1970; режиссер Владимир Храмов, сценарий Виктора Драгунского).
В 1980 г. работал звукорежиссером в Московском академическом театре сатиры.
С 1980 по 1982 г. проходил срочную службу в Вооруженных силах СССР, в подразделениях Дальвоенморстроя Тихоокеанского флота во гг. Владивостоке (Приморский край) и Советской Гавани (Хабаровский край). Во время службы получил специальность "машинист башенного крана".
В 1983-1991 гг. работал в учреждениях культуры Москвы и Московской области. Окончил курсы в Центре подготовки руководителей ВИПКлеспрома по основам внешнеэкономической деятельности. Был звукорежиссером в Московском государственном театре им. Моссовета (1983-1985) и во Дворце культуры Московского института инженеров транспорта (1985-1987). Возглавлял дом культуры при тресте "Мособлстрой" №20 (1987-1988) в г. Пушкино, был главным режиссером Филевского парка культуры и отдыха (1988-1990) и режиссером Люблинского парка культуры и отдыха (1990-1991) в Москве.
Параллельно в 1986 г. совместно с известным гитаристом Алексеем Тумановым создал рок-группу "Мост", где был соавтором большинства песен, выступал в качестве вокалиста и бас-гитариста. Позднее участвовал в создании рок-группы "Морской патруль" вместе с музыкантом Юрием Стожаровым.
В 1990-1993 гг. возглавлял правление Фонда протоиерея Александра Меня, занимался предпринимательской деятельностью, изданием собрания сочинений своего отца.
С 1993 по 1995 г. - депутат Московской областной думы от Сергиево-Посадского района. Был избран в областной парламент 12 декабря 1993 г. В Мособлдуме входил в комитет по законодательству, вопросам власти и местного самоуправления.
Был членом объединения (ныне партии) "Яблоко". Вышел из него в 2000 г.
В 1995-1999 гг. - депутат Государственной думы РФ II созыва. Избран 17 декабря 1995 г. по Дмитровскому одномандатному округу №104 Московской области. Баллотировался от объединения "Яблоко". Получил 18,24% голосов избирателей. В Думе занимал пост заместителя председателя комитета по культуре Станислава Говорухина, входил в депутатскую фракцию "Яблоко".
В 1996-1998 г. возглавлял общероссийское общественное движение "Всероссийский христианский союз".
В 2000-2002 гг. – вице-губернатор, первый заместитель председателя правительства Московской области. Был избран на должность в 9 января 2000 г. в ходе второго тура выборов главы Подмосковья. Баллотировался в паре с кандидатом на пост губернатора Борисом Громовым. В первом туре пара Громов-Мень получила 20,91% голосов избирателей, уступив кандидатам от КПРФ Геннадию Селезневу и Владимиру Кашину (27,52%). Во втором туре голосования 9 января 2000 г. Громов и Мень набрали 48,09% голосов, пара Селезнева и Кашина - 46,39%. 2 февраля 2000 г. Михаил Мень официально приступил к обязанностям вице-губернатора. Занимал должность до ноября 2002 г.
С ноября 2002 г. по ноябрь 2005 г. - заместитель мэра Москвы Юрия Лужкова, курировал вопросы межрегионального сотрудничества и спорта. Одновременно в 2003-2005 гг. возглавлял комиссию по правам человека при мэре столицы и комиссию по вопросам помилования на территории Москвы.
В 2005-2013 гг. – губернатор Ивановской области. 22 ноября 2005 г. облдума Ивановской области по представлению президента РФ Владимира Путина единогласно наделила Михаила Меня полномочиями губернатора региона. 23 декабря того же года он вступил в должность. 22 октября 2010 г. он вновь был утвержден на посту губернатора по представлению главы государства Дмитрия Медведева (за - 41 депутат Думы, против - пять). Одновременно возглавлял областное правительство. Занимал пост губернатора до 16 октября 2013 г., ушел в отставку досрочно по собственному желанию.
С 1 ноября 2013 г. по 18 мая 2018 г. возглавлял Министерство строительства и жилищно-коммунального хозяйства РФ, образованного в соответствии с указом президента. Работал в составе правительства Дмитрия Медведева.
Являлся председателем попечительского совета Федерального фонда содействия развитию жилищного строительства (2014-2017).
20 июня 2018 г. по представлению президента России назначен Советом Федерации аудитором Счетной палаты РФ (председатель палаты в 2013-2019 гг. - Татьяна Голикова, с 2019 г. - Алексей Кудрин). Курировал направление контрольной деятельности в области расходования средств федерального бюджета в сфере природопользования и АПК. Досрочно освобожден от должности аудитора Совфедом 2 июня 2021 г.
18 ноября 2020 г. Михаил Мень был задержан в своем доме в пос. Архангельское Красногорского района Московской области сотрудниками Службы экономической безопасности ФСБ и Главного управления экономической безопасности и противодействия коррупции МВД России. В тот же день Совет Федерации РФ дал согласие генпрокурору на привлечение его в качестве обвиняемого по уголовному делу о хищении средств из бюджета Ивановской области и применение меры пресечения в виде запрета определенных действий. Следственный комитет РФ предъявил Меню обвинение в растрате (ч. 4 ст. 160 УК РФ). По версии следствия, в 2011 г. Мень, являясь губернатором Ивановской области, совместно с бенефициарами группы компаний "Продо" организовал преступную группу в целях хищения бюджетных денежных средств, выделенных в качестве кредита из Министерства финансов РФ для поддержки региона. Подозреваемые похитили 700 млн руб. из регионального бюджета, перечислив их на счета ОАО "Ивановский бройлер", входящего в "Продо". В преступную группу входил также экс-губернатор Ивановской области Павел Коньков, занимавший в то время пост заместителя председателя правительства региона, дело в отношении него было возбуждено в мае 2019 г. 19 ноября суд избрал Меню меру пресечения в виде запрета определенных действий (ему было запрещено покидать место проживания, получать почтово-телеграфные отправления и др.). 20 апреля 2021 г. Верховный суд РФ смягчил меру пресечения на подписку о невыезде, 17 мая того же года уголовное дело в отношении Меня и Конькова было прекращено за истечением срока давности.
Член Всероссийской политической партии "Единая Россия". С 2017 г. входил в генеральный совет и президиум генсовета "Единой России". Приостановил членство в партии в июне 2018 г. в соответствии с законом "О Счетной палате Российской Федерации".
Член Союза композиторов России.
Общая сумма декларированного дохода за 2013 г. составила 7 млн 934 тыс. руб., супруги – 87 365 тыс. руб.
Общая сумма декларированного дохода за 2014 г. составила 11 млн 471 тыс. руб., супруги – 23 млн 593 тыс. руб.
Общая сумма декларированного дохода за 2015 г. составила 13 млн 222 тыс. руб., супруги – 42 млн 143 тыс. руб.
Общая сумма декларированного дохода за 2016 г. составила 11 млн 796 тыс. руб., супруги – 51 млн 461 тыс. руб.
Общая сумма декларированного дохода за 2017 г. составила 10 млн 961 тыс. руб., супруги – 73 млн 201 тыс. руб.
Общая сумма декларированного дохода за 2018 г. составила 11 млн 862 тыс. руб., супруги – 48 млн 864 тыс. руб.
Общая сумма декларированного дохода за 2019 г. составила 10 млн 278 тыс. руб., супруги - 58 млн 836 тыс. руб.
Награжден орденами Почета (2011), Дружбы (2014), медалью П. А. Столыпина I степени. Имеет три благодарности президента РФ.
Награжден также орденами Русской православной церкви - Преподобного Сергия Радонежского II и III (2007, 2001) степеней, Святого благоверного князя Даниила Московского III степени.
Почетный строитель России.
Почетный профессор Московского архитектурного института (МАРХИ), почетный доктор Института теологии Белорусского государственного университета.
Автор ряда книг и публикаций, в том числе "Земля. Проблемы землепользования и инвестиционный процесс в Подмосковье" (2002), "Лидерство как социальный и личностный феномен" (2011).