Родился 13 июня 1981 г. в пос. Верея Орехово-Зуевского района Московской области в семье директора крупного транспортного предприятия.
В 2003 г. окончил Владимирский государственный педагогический университет по специальности "юриспруденция", в 2012 г. - Российскую академию народного хозяйства и государственной службы при президенте РФ по специальности "государственное и муниципальное управление".
В 2000-х гг. работал юристом в ООО "Мигеко" (г. Орехово-Зуево Московской обл.).
Занимался предпринимательской деятельностью.
С 2003 г. состоял в "Молодой гвардии "Единой России" (МГЕР), был руководителем отделения организации в г. Орехово-Зуево, заместителем начальника московского областного регионального штаба МГЕР. В 2006 г. стал одним из победителей партийного проекта "Единой России" "ПолитЗавод-2006".
В 2008-2014 гг. - депутат Совета депутатов городского округа Орехово-Зуево. 2 марта 2008 г. на дополнительных выборах был избран по одномандатному округу №9. Выдвигался от "Единой России". 1 марта 2009 г. переизбран от "Единой России" в Совет депутатов Орехово-Зуево по одномандатному округу №25.
В 2009-2014 гг. - председатель Совета депутатов городского округа Орехово-Зуево.
4 декабря 2011 г. баллотировался в Московскую областную Думу по списку "Единой России" под третьим номером в региональной группе №15 (Орехово-Зуевская). В Думу не прошел.
В 2014-2021 г. – глава городского округа Орехово-Зуево. 14 сентября 2014 г. был избран от "Единой России", получив 58,24% (его ближайший соперник – самовыдвиженец, помощник адвоката Игорь Пантюшин – 19,21%). В июле 2016 г. досрочно сложил с себя полномочия с тем, чтобы в дальнейшем совмещать должности главы и руководителя администрации городского округа. В июле – сентябре 2016 г. - врио главы Орехово-Зуево и руководитель администрации округа. 14 сентября 2016 г. Совет депутатов городского округа Орехово-Зуево избрал Геннадия Панина главой муниципального образования на пять лет. Его кандидатуру поддержали 19 из 20 присутствующих депутатов. В сентябре 2021 г. Геннадий Панин сложил полномочия главы округа в связи с избранием депутатом Госдумы РФ.
С октября 2014 г. – секретарь Орехово-Зуевского отделения партии "Единая Россия".
С 2021 г. - депутат Государственной думы РФ VIII созыва от "Единой России". Был избран 19 сентября 2021 г. по Орехово-Зуевскому одномандатному округу №123 (Московская обл.). Набрал 56,16% голосов (второе место в округе занял кандидат от КПРФ Дмитрий Аграновский - 19,05%). Член фракции единороссов. С 12 октября 2021 г. - первый заместитель председателя комитета Госдумы по региональной политике и местному самоуправлению.