Родился 15 мая 1959 г. в городке Веце (земля Северный Рейн-Вестфалия). Его отец был сельскохозяйственным рабочим, мать - уборщицей.
В 1981 гг. окончил институт в Дюссельдорфе (социальная педагогика), в 1987 г. - Университет Кёльна (юриспруденция). В 1981-1991 гг. был клерком в суде г. Клеве, в 1991 г. получил лицензию на работу в качестве адвоката.
С 1975 г. член Христианско-демократического союза (ХДС), одной из крупнейших партий ФРГ. В 1986-1992 гг. возглавлял молодежную организацию ХДС и Христианско-социального союза (ХСС) в земле Северный Рейн-Вестфалия.
В 1990-2014 гг. - депутат Бундестага, в 2002-2004 гг. был юридическим советником фракции ХДС/ХСС, а в 2004-2005 гг. - заместителем председателя фракции.
В 1991-2007 гг. занимал пост председателя отделения ХДС в округе Клеве, в 2000-2014 гг. возглавлял партийную организацию в регионе Нижний Рейн. В 2005 г. по предложению канцлера ФРГ и председателя ХДС Ангелы Меркель был избран генеральным секретарем партии (оставался на этом посту до 2009 г.).
В 1995-2010 гг. входил в состав правления Фонда имени Конрада Аденауэра (организация, близкая к ХДС, цель которой - способствовать развитию правового государства, демократии, рыночной экономики).
В 2009-2013 гг. - руководитель ведомства федерального канцлера и министр по особым поручениям. В этой должности координировал взаимодействие всех министерств, а также работу спецслужб. В 2013 г., когда в Германии разгорелся скандал из-за разоблачений бывшего сотрудника ЦРУ США Эдварда Сноудена, заявившего в частности, что на территории Германии велась слежка со стороны США, деятельность Пофаллы была подвергнута критике со стороны некоторых депутатов Бундестага. Его обвинили в некомпетенции, так как он не смог предоставить парламентскому контрольному комитету достаточно данных о расследовании обстоятельств слежки.
На должности руководителя ведомства канцлера много внимания уделял вопросам, связанным с Белоруссией. Выступал за соблюдение демократических свобод и прав человека, встречался с представителями оппозиции и неправительственных организаций.
В 2014 г. решил уйти из политики в бизнес и принял предложение государственного железнодорожного концерна Deutsche Bahn. Пофалла отложил вступление в новую должность на год, так как в Германии бывшие политики, занявшие высокопоставленные посты в крупных компаниях, воспринимаются негативно - считается, что они используют свои политические связи. С января 2015 г. является генеральным уполномоченным концерна по вопросам международных отношений и возглавляет специально созданный отдел "Экономика, политика и регулирование".
Покинув политику, Пофалла остался в окружении Ангелы Меркель (в СМИ неоднократно подчеркивалось, что Пофалла является "правой рукой" канцлера и она ему полностью доверяет).
5 мая 2015 г. члены германского координационного комитета российско-германской общественной организации "Петербургский диалог" избрали Пофаллу председателем комитета. На новой должности поставил целью "как можно быстрее совместно с российскими партнерами найти новую дату" для заседания организации, которое было отменено на фоне антироссийских санкций.
Является добровольным сотрудником организации Bundesanstalt Technisches Hilfswerk (аналог российского МЧС), действующей при МВД ФРГ, и Общества по спасению жизни.
Дважды разведен, детей нет.