Родился 23 февраля 1960 г. в с. Джурков Коломыйского района Ивано-Франковской обл. Украинской ССР (ныне - Украина).
В 1979 г. окончил Коломыйское педагогическое училище, в 1986 г. - факультет истории и коммунистического воспитания Высшей комсомольской школы при ЦК ВЛКСМ по специальности "преподаватель истории и обществоведения", в 1994 г. - Академию народного хозяйства при правительстве РФ (ныне - Российская академия народного хозяйства и государственной службы при президенте РФ) по специальности "менеджер высшей категории".
Кандидат экономических наук. В 1995 г. в Академии народного хозяйства при правительстве РФ защитил диссертацию на тему "Стратегия управления развитием малого бизнеса в регионе".
Доктор экономических наук. В 1999 г. в Высшей школе приватизации и предпринимательства защитил диссертацию на тему "Реформирование управления экономикой субъекта Российской Федерации".
С 1979 г. работал учителем начальных классов Кончаковской средней школы Галичского района (Иваново-Франковская обл.).
В 1980-1982 г. служил в рядах Советской Армии.
С 1986 г. работал вторым, с мая 1987 г. - первым секретарем Холмского районного комитета ВЛКСМ Новгородской обл.
В 1987 г. избран депутатом Холмского районного совета.
В 1988-1991 гг. возглавлял совхоз "Трудовик" (Холмский район Новгородской обл.).
В 1989 г. избран народным депутатом СССР по квоте ВЛКСМ. Входил в Межрегиональную депутатскую группу. Был членом комитета Верховного совета СССР по вопросам работы советов народных депутатов, развития управления и самоуправления.
В 1991 г. на выборах первого президента РСФСР входил в числе доверенных лиц Бориса Ельцина.
24 октября 1991 г. указом президента РСФСР Бориса Ельцина назначен главой администрации Новгородской области.
В 1993 г. вошел в политический совет Партии российского единства и согласия.
В декабре 1993 г. избран депутатом Совета Федерации Федерального собрания РФ первого созыва по Новгородскому округу № 53. Входил в комитет по делам СНГ.
В 1995 г. вошел в оргкомитет движения "Наш дом - Россия".
17 декабря 1995 г. избран губернатором Новгородской области, получив 56,17% голосов избирателей. Второе место занял помощник генерального директора новгородского предприятия "Агропромэнерго" Анатолий Кузнецов - 8,94%.
В 1996-2001 гг. - член Совета Федерации ФС РФ (представитель от исполнительной власти Новгородской обл.). Возглавлял комитет по международным делам.
С 1999 г. по 2001 г. - заместитель председателя Парламентской ассамблеи Совета Европы (ПАСЕ). Входил в Межведомственную комиссию РФ по делам Совета Европы.
5 сентября 1999 г. победил на выборах губернатора Новгородской области. За него проголосовали 91,56% избирателей. Его ближайший соперник, директор новгородского предприятия "Шелонь" Анатолий Пешков набрал 1,62%.
В сентябре 2001 г. избран председателем Демократической партии России. В 2003 г. был исключен за невыполнение взятых на себя финансовых обязательств и нежелание повести партию на выборы в Госдуму.
7 сентября 2003 г. вновь избран губернатором Новгородской обл., набрав 78,73% голосов избирателей (баллотировался в порядке самовыдвижения). Второе место занял самовыдвиженец, директор Союза промышленников и предпринимателей Санкт-Петербурга Владимир Дугенец - 4,39%.
В феврале 2005 г. вступил в партию "Единая Россия". В июне того же года возглавил региональное отделение партии в Новгородской области.
3 августа 2007 г. президент РФ Владимир Путин принял добровольную отставку Михаила Прусака с поста руководителя Новгородской области. Врио губернатора региона был назначен Сергей Митин.
С 2007 г. являлся помощником руководителя Администрации президента РФ (глава Администрации - Сергей Собянин).
С 2010 г. занимал должность генерального директора ООО "Агропроминвест" (Москва).
В 1999-2002 гг. - член совета директоров РАО "ЕЭС России".
Действительный государственный советник РФ 3 класса (2007).
Награжден орденами Дружбы (1996), "За заслуги перед Отечеством" II степени (1999), князя Ярослава Мудрого V степени (Украина; 2004), Командорским крестом Ордена за заслуги перед ФРГ (2005).
Лауреат премии правительства РФ 2005 г. в области науки и техники "за разработку и внедрение дешевых экономичных малогабаритных квартир в кирпичных жилых домах для расселения граждан из ветхого и аварийного жилья в малых и средних городах России".
Действительный член Академии педагогических и социальных наук, Санкт-Петербургской инженерной академии, Международной Академии информатизации.
Почетный доктор Санкт-Петербургского государственного инженерно-экономического университета.
Автор книги "Реформы в провинции" (1999).