Родился 11 февраля 1969 г. в гор. Арске (Татарская АССР, ныне Республика Татарстан).
В 1993 г. окончил юридический факультет Казанского государственного университета им. В. И. Ульянова-Ленина (КГУ; ныне Казанский федеральный университет, КФУ) по специальности "правоведение". В 2000 г. завершил обучение по специальности "менеджмент" в Казанском финансово-экономическом институте (в 2011 г. КФЭИ вошел в состав КФУ).
Кандидат юридических наук. В 2004 г. в КГУ защитил диссертацию по теме "Ответственность осужденных за злостное уклонение от наказаний, не связанных с изоляцией от общества в российском уголовном праве".
В 1993-1995 гг. - ассистент кафедры истории и права КФЭИ.
В 1995-1998 гг. - старший преподаватель кафедры уголовного права, в 1998-2008 гг. - доцент кафедры уголовного права и криминологии КГУ.
В 2008-2009 гг. - заместитель директора по экономике и финансам, в 2009-2010 гг. - директор государственного казенного учреждения "Главтатдортранс" (Казань).
С апреля 2010 г. по 2020 г. Ленар Сафин занимал должность министра транспорта и дорожного хозяйства Республики Татарстан. Сначала работал в правительстве Ильдара Халикова, с апреля 2017 г. - в кабинете министров Алексея Песошина.
В 2020-2022 гг. - член Совета Федерации РФ. 18 сентября 2020 г. президент Татарстана Рустам Минниханов, избранный на очередной срок, наделил Ленара Сафина полномочиями сенатора, представителя от исполнительного органа власти республики. В Совфеде Ленар Сафин сменил Олега Морозова, который перешел в нижнюю палату российского парламента. С ноября 2020 г. был первым заместителем председателя комитета СФ по экономической политике. В сентябре 2022 г. подал заявление о сложении полномочий сенатора в связи с назначением ректором КФУ.
С августа 2022 г. Ленар Сафин является ректором Казанского (Приволжского) федерального университета (назначен распоряжением правительства РФ от 19 августа 2022 г. сроком на пять лет).
С ноября 2022 г. - председатель Совета ректоров вузов Республики Татарстан.
Награжден орденами Почета (2019), Александра Невского (2024), медалью ордена "За заслуги перед Отечеством" II степени (2014). Имеет благодарность президента РФ (2017).
Почетный работник транспорта России (2013). Заслуженный строитель Республики Татарстан (2016).