Родился 1 июня 1949 г. в г. Сус.
Изучал экономику в Тунисском университете, затем продолжил обучение в США, где в 1975 г. получил степень магистра в Миннесотском университете по специальности "экономика сельского хозяйства".
В 1975-1980 гг. занимал различные должности в министерстве сельского хозяйства.
В 1980-1988 г. управлял проектами по ирригации в провинции Гафса.
В 1989 г. руководил проектом по развитию сельскохозяйственного развития провинции Бизерта.
В 1993-1997 гг. - секретарь в министерстве сельского хозяйства, в 1997-2001 гг. в министестве внутренних дел.
С 2001 по 2002 г. находился на посту государственного секретаря по рыболовству при министерстве сельского хозяйства, в 2002-2003 гг. — госсекретаря по окружающей среде.
В 2003-2004 гг. возглавлял Организацию трубопроводных транспортировок по Сахаре.
В 2004-2010 гг. занимал должность исполнительного директора Международного совета по оливкам (штаб-квартира в Мадриде).
После событий "арабской весны" в Тунисе в марте 2011 г. эс-Сид был назначен министром внутренних дел во временном правительстве.
В декабре 2011 г. - феврале 2013 г. занимал пост советника по безопасности премьер-министра Хамади Джебали.
5 января 2015 г. президент Туниса Бежи Каид ас-Себси поручил Хабибу эс-Сиду сформировать правительство (приведено к присяге 6 февраля). В сформированный им кабинет министров вошли представители "Нидаа Тунис", исламистской "Ан-Нахда", а также парламентских фракций "Патриотический свободный союз" и "Афек Тунис", кроме того треть министерских портфелей достались внепартийным политикам и представителям гражданского общества. Эс-Сид заявил в программной речи перед депутатами, что ключевыми приоритетами его команды станут обеспечение безопасности, борьба с терроризмом, теневой экономикой и ростом цен, а также обеспечение равномерного развития регионов страны и реформирование налоговой системы.
30 июля 2016 г. Ассамблея народных представителей (парламент) Туниса вынесла вотум недоверия действующему правительству республики во главе с премьер-министром Хабибом эс-Сидом.
Владеет французским и английским языками.
Женат, имеет троих детей.