Родился 21 мая 1974 г. в Минске.
В 1991 г. закончил Минское суворовское военное училище. В 1997 г. - Российскую экономическую академию (ныне - университет) им. Г. В. Плеханова.
Отец Хотина, Юрий, с начала 1990-х гг. был владельцем белорусских фирм "Астор", Алатард" и "Белкосмекс", выпускавшей косметику и бытовую химию. В середине 1990-х гг. он вместе с сыном переехал в Москву, где они арендовали для производства бытовой химии помещения мясокомбината "Микомс" (бывш. им. Микояна). После этого они начали скупать московские фабрики, занимавшиеся косметикой и бытовой химией, в том числе "Московский мыловаренный завод" и "Гелиос-М". С начала 2000-х гг. Хотины решили, что выгоднее реконструировать промышленные площади под офисы и активно занялись девелоперским бизнесом, скупая площади бывших фабрик и НИИ.
В 2011 г. Хотины за 500 млн долларов США приобрели торговые комплексы "Горбушкин двор" и "Филион", а в 2015 г. стали владельцами гостиницы "Москва" (работает под брендом Four Seasons). Сумма последней сделки оценивалась на сумму в 160-450 млн долларов США. В 2017 г. они продали "Горбушкин двор" за 500 млн долларов.
Единой компании для контроля над своими активами у Хотиных не было. По оценке российской версии журнала Forbes, им принадлежало через десятки различных фирм и офшоров около 1,8 млн кв. м торгово-офисных площадей.
По данным СМИ, в 2000-х гг. Алексей Хотин был советником председателя Совета Федерации РФ Сергея Миронова. Сам бывший спикер заявлял, что с Хотиным не был знаком.
В начале 2010-х гг. Алексей Хотин занялся диверсификацией бизнеса и начал вкладываться в нефтедобывающую отрасль. Имя его отца уже в этом бизнесе не упоминалось. В 2013 г. Алексей Хотин вместе с бизнесменом Александром Клячиным стал крупнейшим совладельцем зарегистрированной в Лондоне компании Exillon Energy ("Эксилон енерджи"), владеющей нефтяными активами в России.
С 2014 г. Алексей Хотин назывался в СМИ совладельцем банка "Югра". Эта кредитная организация, занимавшая в 2012 г. 272-е место по величине активов в России, в 2016 г. вошла в топ-30 по объему активов. В том же году ЦБ РФ вынудил банк раскрыть бенефициара главной компании-совладельца банка (52% акций) - швейцарской Radamant Financial AG ("Радамант файнэншл АГ"). Выяснилось, что ею владеет Алексей Хотин. Еще 0,5% акций "Югры" Хотин владел непосредственно.
10 июля 2017 г. Банк России (ЦБ РФ) ввел мораторий на удовлетворение требований кредиторов банка "Югра" сроком на три месяца. Одновременно регулятор на шесть месяцев возложил на Агентство по страхованию вкладов функции временной администрации по управлению банком. В пресс-релизе регулятора отмечалось, что Центробанк пошел на такие меры в связи с неустойчивым финансовым положением "Югры". 27 июля Алексей Хотин заявил, что направил ЦБ РФ план по финансовому оздоровлению банка, рассчитанный до 2027 г., который предусматривал погашение задолженности перед АСВ под залог кредитного портфеля и личное поручительство бизнесмена. Однако 28 июля 2017 г. регулятор отозвал у "Югры" лицензию. По данным регулятора, владельцы банка "Югры" за счет депозитов физических лиц кредитовали собственные компании. При этом выявлялись факты вывода активов, сомнительных транзитных операций и предоставления недостоверных отчетных данных. Впоследствии выяснилось, что "дыра" в капитале банка составила 160 млрд руб. В сентябре 2018 г. Арбитражный суд Москвы признал "Югру" банкротом. Крах банка стал самым крупным в истории современной российской банковской системы, вкладчикам была выплачена рекордная страховая сумма - более 170 млрд руб.
После возникновения проблем с банком "Югра" сообщалось, что Алексей Хотин покинул в Россию. Вслед за этим он сконцентрировался на нефтедобывающей отрасли: в 2018-2019 гг. его Exillon Energy приобрела несколько крупных месторождений в Тимано-Печоре и Западной Сибири.
19 апреля 2019 г. Следственный комитет РФ сообщил о задержании Алексея Хотина по обвинению в хищении (ч. 4 ст. 160 УК РФ) 7,5 млрд руб. у своего банка. В тот же день он был помещен под домашний арест.
С 2016 г. российская версия журнала Forbes включала Алексея Хотина в число богатейших бизнесменов России. В рейтинге за 2019 г. его состояние было оценено в 700 млн долларов.
Алексей Хотин женат. Супруга - Александра. Сын - Дмитрий, дочь - Анна.