Родился 20 января 1952 г. в Славгороде (Алтайский край) в семье Ивана Афанасьевича и Валентины Васильевны Хотиненко. Его родители работали на заводе кузнечно-прессового оборудования "8 лет Октября", который был эвакуирован в Славгород после начала Великой Отечественной войны из подмосковного Серпухова.
С 1960-х гг. вместе с семьей проживал в Павлодаре (Казахская ССР, ныне Республика Казахстан). В старших классах школы участвовал в деятельности местного юношеского военно-патриотического объединения "Гринабель". Активно занимался спортом, стал чемпионом Казахской ССР среди школьников по прыжкам в высоту, впоследствии входил в сборную республики по легкой атлетике.
В 1969-1970 гг. работал художником-конструктором на Павлодарском тракторном заводе им. В. И. Ленина.
В 1976 г. Владимир Хотиненко с отличием окончил факультет промышленной архитектуры Свердловского архитектурного института (ныне Уральский государственный архитектурно-художественный университет, Екатеринбург). В студенческие годы выступал в свердловских рок-группах "Синкопа" и "Машина времени" (не путать с московской рок-группой, созданной Андреем Макаревичем).
Работа в кино
После окончания вуза Владимир Хотиненко был призван на срочную службу во внутренних войсках МВД СССР в Свердловске. Во время краткосрочного отпуска познакомился с режиссером Никитой Михалковым, который порекомендовал ему после окончания службы пойти работать в кино.
В 1977-1982 гг. являлся ассистентом художника и художником-постановщиком на Свердловской киностудии. Принимал участие в работе над фильмами "Гонка с преследованием" (1979, режиссер Ольгерд Воронцов), "Дым Отечества" (1980, Ярополк Лапшин) и др.
Владимир Хотиненко был ассистентом на съемках фильмов Никиты Михалкова "Пять вечеров" по мотивам пьесы Александра Володина (1978), "Несколько дней из жизни И. И. Обломова" по мотивам романа Ивана Гончарова "Обломов" (1979) и "Родня" (1981). Их производство вела киностудия "Мосфильм".
В 1981 г. окончил в Москве Высшие курсы сценаристов и режиссеров, где обучался в мастерской Никиты Михалкова.
Режиссерским дебютом Владимира Хотиненко стал приключенческий фильм "Один и без оружия" по детективу Николая Леонова "Агония". Он был снят в 1984 г. совместно с Павлом Фаттахутдиновым на Свердловской киностудии. Там же Хотиненко поставил историко-революционную картину "В стреляющей глуши" (1986), фантастическую кинопритчу "Зеркало для героя" по мотивам повести Святослава Рыбаса (1987), драму "Рой" по роману Сергея Алексеева (1990), криминальную мелодраму "Макаров" (1993; в 1994 г. удостоена кинопремии "Ника" в номинации "Лучший игровой фильм").
К его наиболее известным режиссерским работам последующих лет относятся драмы "Мусульманин" по сценарию Валерия Залотухи (1995) и "72 метра" по произведениям Александра Покровского (2004; в 2005 г. отмечена кинопремией "Золотой орел" в категории "Лучший игровой фильм"), историческая кинолента "Поп" (2009), сериалы "Гибель империи" (2005), "Достоевский" (2011) и "Бесы" по роману Федора Достоевского (2014). Был сценаристом и продюсером ряда своих кинокартин, часть из них снял на собственной студии "Рой".
В 2005 г. выступил в качестве режиссера документального мини-сериала "Паломничество в Вечный город".
В общей сложности поставил более 20 кинолент и сериалов. Последним на данный момент фильмом Хотиненко является историческая драма "Ленин. Неизбежность", вышедшая в 2019 г.
В качестве актера снимался в фильмах "Родня" (1981, режиссер Никита Михалков), "Казачья застава" (1982, Виктор Живолуб), "За кем замужем певица?" (1988, Олег Николаевский) и др.
Педагогическая деятельность
С 1994 г. Владимир Хотиненко преподает во Всероссийском государственном институте кинематографии им. С. А. Герасимова. Заведующий кафедрой режиссуры игрового фильма, член ученого совета вуза. Профессор (2006).
С 1999 г. совместно с Павлом Финном и Владимиром Фенченко руководит мастерской режиссеров игрового кино на Высших курсах сценаристов и режиссеров.
Работа на телевидении, книги
В 2010-2015 гг. Владимир Хотиненко являлся ведущим телевизионного проекта "Смотрим... Обсуждаем" ("Россия-Культура").
Автор книг "Новые русские бесы" (2014) и "Зеркало для России" (2016). В 2011 г. была издана книга "Кинообразование. Мастер-класс 01": в ней представлена система упражнений, которую Владимир Хотиненко использует в своей преподавательской деятельности.
Членство в профессиональных организациях
Владимир Хотиненко является членом Союза кинематографистов РФ, Российской академии кинематографических искусств, Национальной академии кинематографических искусств и наук России.
Общественная деятельность
Член Патриаршего совета по культуре, общественного совета при Министерстве культуры РФ, бюро президиума Общества русской словесности.
Входит в состав попечительского совета Национального фонда поддержки правообладателей.
В 2011-2018 гг. Владимир Хотиненко был членом Совета при президенте РФ по культуре и искусству.
В 2017-2020 гг. являлся членом Общественной палаты РФ. Был первым заместителем председателя комиссии по вопросам развития культуры и сохранению духовного наследия.
В 2012 и 2018 гг. являлся доверенным лицом кандидата на пост президента РФ Владимира Путина, в 2018 г. - кандидата на пост мэра Москвы Сергея Собянина.
Признание
Заслуженный деятель искусств РФ (2001). Народный артист РФ (2010).
Владимир Хотиненко награжден орденом Почета (2019).
Лауреат кинопремии "Ника" в номинации "Лучшая режиссерская работа" (1994, "Макаров"), премии ТЭФИ в категории "Сценарист телевизионного документального фильма/сериала" (2006, "Паломничество в Вечный город", серия "Апостол Павел").
Личные сведения
Женат. Супруга Татьяна Яковлева - кандидат искусствоведения, мастер киноведческого отделения сценарно-киноведческого факультета Всероссийского государственного института кинематографии им. С. А. Герасимова. От предыдущих браков Владимир Хотиненко имеет сына Илью (род. 1972), ставшего кинорежиссером, и дочь Полину (род. 1981), которая работает диджеем. Сестра - Татьяна Кузина (род. 1949) - председатель Славянского культурного центра Павлодарской области Казахстана.