Родился 23 декабря 1940 г. в г. Агра (Британская Индия) в семье предпринимателя. В 1949 г., спустя два года после разделения Индии на два государства — Индийский Союз и Пакистан, семья Хусейна, принадлежащая к этнической группе, говорящей на урду, мигрировала в Пакистан. Отец открыл текстильную фабрику в г. Карачи (провинция Синд).
В 1963 г. окончил Университет Карачи, где изучал торговое дело. В 1965 г. получил степень магистра в Институте делового администрирования при Университете Карачи (в настоящее время - самостоятельный университет).
После учебы присоединился к семейному текстильному бизнесу. В 1968 г. стал членом партии "Мусульманская лига Пакистана", вскоре был избран секретарем ее отделения в Карачи.
В 1988 г. от партии откололась фракция, получившая название "Пакистанская мусульманская лига" (фракция Наваза Шарифа), или ПМЛ (Н). С 1993 г. Мамнун Хусейн активно в ней работал, занял пост финансового секретаря регионального отделения в провинции Синд, в 2001-2005 гг. был его генеральным секретарем. В 2005 г. был назначен первым заместителем председателя ПМЛ (Н) и вошел в состав центрального исполнительного комитета фракции.
В 1997—1998 гг. был советником главного министра провинции Синд.
В начале 1999 г. возглавлял Торгово-промышленную палату Карачи.
С июня по октябрь 1999 г. был губернатором провинции Синд, смещен с должности после военного переворота под руководством Первеза Мушаррафа.
30 июля 2013 г. избран коллегией выборщиков на пост президента Исламской Республики Пакистан. Принял присягу 9 сентября 2013 г. Став главой государства, покинул партийную должность. Занимал должность президента до сентября 2018 г.
В феврале 2020 г. у него диагностировали рак. 14 июля 2021 г. он скончался в возрасте 80 лет.
Был женат, трое сыновей (занимаются банковским бизнесом).
Исповедовал ислам.