Родилась 31 января 1991 г. в Шанхае (Китай). Играет в шахматы с детства.
В 2004 г. в Бейруте (Ливан) заняла второе место на чемпионате Азии.
В 2006 г. в Екатеринбурге дебютировала на чемпионате мира по шахматам.
В 2010 и 2014 гг. Цзюй Вэньцзюнь выигрывала чемпионат Китая по шахматам.
В 2010 г. в Гуанчжоу (КНР) Цзюй Вэньцзюнь в составе сборной Китая одержала победу на Азиатских играх.
В 2014 г. стала 31-й женщиной-гроссмейстером (Grandmaster, GM) в истории мировых шахмат.
В 2016 г. в Баку (Азербайджан) в составе сборной Китая первенствовала на 42-й Всемирной шахматной олимпиаде. В том же году одержала победу в серии Гран-при и получила право участия в матче на первенство мира.
В 2017 г. в Эр-Рияде (Саудовская Аравия) и в 2018 г. в Санкт-Петербурге становилась чемпионкой мира по быстрым шахматам.
В мае 2018 г. в матче за звание чемпионки мира по шахматам (проходил в Шанхае и Чунцине) обыграла действовавшую обладательницу титула - соотечественницу Тань Чжунъи. В ноябре того же года в Ханты-Мансийске стала чемпионкой мира по нокаут-системе. В финале нанесла поражение россиянке Екатерине Лагно.
В январе 2020 г. во Владивостоке в матче за звание чемпионки мира обыграла россиянку Александру Горячкину.
Рейтинг ФИДЕ по состоянию на январь 2020 г.: 2584 балла (второе место среди шахматисток мира, уступает соотечественнице Хоу Ифань).