Родился 31 марта 1968 г. в Москве в семье советского ученого, профессора Анатолия Федоровича Чаплина.
В 1990 г. окончил Московскую духовную семинарию, в 1994 г. - Московскую духовную академию.
Был кандидатом богословия. Защитил диссертацию "Проблема соотношения естественной и богооткровенной новозаветной этики в современной зарубежной инославной и нехристианской мысли".
21 апреля 1991 г. был рукоположен в сан диакона, 7 января 1992 г. - в сан пресвитера.
В 1985-1990 гг. являлся сотрудником Издательского отдела Русской православной церкви Московского патриархата (РПЦ МП).
С 1990 по 2009 г. работал в Отделе внешних церковных связей (ОВЦС) РПЦ МП. Возглавлял секретариат ОВЦС по взаимоотношениям Церкви и общества. В 2001-2009 гг. был заместителем председателя ОВЦС.
В 1990-2000 гг. являлся членом Центральных комитетов Всемирного совета церквей (ВСЦ) и Конференции европейских церквей (КЕЦ); был сомодератором комиссии "Церковь и общество" КЕЦ, членом комиссии Церквей по международным делам ВСЦ.
В 1999 г. был возведен в сан протоиерея.
С 2009 г. был настоятелем храма святителя Николая на Трех Горах в Пресненском районе Москвы.
С 31 марта 2009 г. по 24 декабря 2015 г. - председатель Синодального отдела по взаимоотношениям Церкви и общества Московского патриархата РПЦ.
Одновременно, с 22 марта 2011 г. по 24 декабря 2015 г., являлся членом Высшего Церковного совета РПЦ.
До 24 декабря 2015 г. был представителем Русской православной церкви в Межрелигиозном совете России.
С 2016 по 2020 г. был настоятелем храма святого Феодора Студита у Никитских ворот в Москве.
Занимал пост председателя Экспертного совета "Экономика и этика" при Святейшем Патриархе Московском и всея Руси. Входил в Синодальную библейско-богословскую комиссию.
Был заместителем главы Всемирного русского народного собора.
Преподавал в Православном Свято-Тихоновском гуманитарном университете (Москва), был доцентом.
Всеволод Чаплин скоропостижно скончался 26 января 2020 г. в Москве на 52-м году жизни. Похоронен на Троекуровском кладбище столицы.
Входил в состав Совета по взаимодействию с религиозными объединениями при президенте РФ, экспертного совета Комитета Государственной думы РФ по делам общественных объединений и религиозных организаций, Консультативного совета ОБСЕ по вопросам свободы религии и убеждений.
Являлся автором и ведущим программ "Комментарий недели" (телеканал "Союз"), "Время доверия" (радиостанция "Комсомольская правда"), "Вечность и время" (телеканал "Спас").
Был награжден орденом Дружбы (2009), Почетной грамотой президента РФ Дмитрия Медведева (2011; "за заслуги в развитии духовной культуры и укреплении дружбы между народами").
Отмечен церковными орденами: святого благоверного князя Даниила Московского II и III степени (2010, 1996), святителя Иннокентия Московского II степени (2005), преподобного Сергия Радонежского III степени (2013).
Имел орден Российского Императорского дома св. Анны II степени и ряд общественных наград.
Был действительным членом Академии российской словесности, Союза писателей России.
Автор книги воспоминаний "Вера и жизнь. Чтобы не было сора в избе" (2016).