Родился 20 января 1973 г. в Москве.
В 1995 г. окончил юридический факультет Московского государственного университета им. М. В. Ломоносова (специальность "правоведение").
С 1995 г. работает в Банке России.
В 1995-1996 гг. был экономистом 2-й категории, экономистом 1-й категории, ведущим экономистом, главным экономистом в управлении валютного контроля в составе главного управления валютного регулирования и валютного контроля ЦБ РФ.
В 1997-1999 гг. - заместитель начальника управления валютного контроля за капитальными операциями - начальник отдела департамента валютного регулирования и валютного контроля ЦБ РФ.
В 1999-2000 гг. был начальником управления анализа валютных операций департамента валютного регулирования, в 2000-2002 гг. - заместителем директора департамента валютного регулирования, в 2002-2004 - заместителем директора департамента валютного регулирования и валютного контроля.
В 2004-2011 гг. Владимир Чистюхин занимал пост заместителя директора департамента банковского регулирования и надзора Банка России. В 2011-2013 гг. возглавлял департамент финансовой стабильности, в 2013-2014 гг. был первым заместителем руководителя службы Банка России по финансовым рынкам. С 2013 г. входит в совет директоров ЦБ РФ.
С февраля 2014 г. был заместителем председателя Банка России Эльвиры Набиуллиной. 17 января 2022 г. был назначен первым заместителем председателя ЦБ РФ. Курирует вопросы развития финансового рынка.
В 2014-2020 гг. - член наблюдательного совета Группы ВТБ.