Родился 10 сентября 1933 г. в дер. Пруды Воловского района Московской области (ныне в Воловском районе Тульской области).
Образование
В 1952 г. получил квалификацию "техник-механизатор" в Иваньковском сельскохозяйственном техникуме (Тульская обл.).
В 1952-1953 гг. обучался в 8-й Военной авиационной школе первоначального обучения летчиков в гор. Павлограде Днепропетровской обл. Затем перевелся в Батайское военное авиационное училище летчиков им. А. К. Серова, г. Батайск Ростовской области (ныне Краснодарское высшее авиационное училище летчиков им. Героя Советского Союза А. К. Серова; г. Краснодар-5, Краснодарский край). Окончил Батайское ВАУЛ в 1956 г. по специальности "эксплуатация и боевое использование самолетов и их оборудование" (квалификация - "пилот-техник").
В 1957-1959 гг. - слушатель Университета марксизма-ленинизма (г. Бельцы, Молдавская ССР). В 1968 г. окончил Военно-воздушную инженерную академию им. Н. Е. Жуковского в Москве с присвоением квалификации "летчик-космонавт-инженер", в 1972 г. - заочно Военно-политическую академии им. Ленина и стал "офицером с высшим военно-политическим образованием".
В 1971 г. защитил диссертацию на соискание ученой степени кандидата технических наук, позднее стал доктором технических наук.
Служба в ВВС
С 1952 г. проходил службу в Военно-воздушных силах (ВВС) СССР, сначала как курсант летных училищ.
С августа 1956 г. - военный летчик, с июня 1957 г. - старший летчик истребительного авиаполка Одесского военного округа. Служил вместе с будущим космонавтом Виктором Горбатко, который был также выпускником Батайского ВАУЛ.
В 1958 г. ему была присвоена квалификация военного летчика III класса, в 1978 г. - военного летчика II класса. Инструктор парашютно-десантной подготовки ВВС (1960), совершил более 235 прыжков с парашютом.
В отряде космонавтов
9 марта 1960 г. Евгений Хрунов был зачислен слушателем-космонавтом в Центр подготовки космонавтов ВВС СССР (ныне ЦПК им. Ю. А. Гагарина; Звездный городок, Московская обл.). Был одним из 20 летчиков, отобранных в первый отряд космонавтов СССР. В их число входили Юрий Гагарин, ставший первым космонавтом планеты, Герман Титов, Алексей Леонов, Виктор Горбатко и др.
После прохождения курса общекосмической подготовки, 4 апреля 1961 г. Евгений Хрунов был назначен на должность космонавта ЦПК.
В 1965 г. был пилотом дублирующего экипажа космического корабля "Восход-2", с борта которого 18 марта выполнил первый в истории выход в открытый космос Алексей Леонов. С июня 1967 г. проходил подготовку по программе стыковки кораблей "Союз".
15-17 января 1969 г. Евгений Хрунов совершил свой первый и единственный полет в космос в качестве инженера-исследователя. Он был участником группового полета и первой в истории стыковки пилотируемых космических кораблей - "Союза-4" и "Союза-5". Стартовал 15 января на "Союзе-5" вместе с Борисом Волыновым (командир) и Алексеем Елисеевым (бортинженер). 16 января после стыковки Хрунов и Елисеев перешли в "Союз-4" (был запущен 14 января), пилотируемый Владимиром Шаталовым. Переход осуществлялся через открытый космос (разгерметизированные орбитальные отсеки кораблей), что было сделано впервые. В то время "Союзы" не имели переходного люка, в качестве шлюзовой камеры использовались их орбитальные отсеки. 17 января спускаемый аппарат "Союза-4" вернул Шаталова, Хрунова и Елисеева на Землю. Волынов возвратился из полета на "Союзе-5" 18 января.
Всего Евгений Хрунов провел в полете 1 день 23 часа 45 минут, в открытом космосе он находился 37 минут.
23 января 1969 г. ему была присвоена категория космонавта III класса.
С апреля 1969 г. Хрунов был командиром отряда космонавтов и одновременно заместителем начальника 3-го отдела 1-го управления, старшим инструктором-космонавтом. С апреля 1974 г. - космонавт 2-го отдела 1-го управления. С марта 1976 г. - командир группы авиационно-космических средств, инструктор-космонавт. С января 1979 г. - начальник 3-го отделения, инструктор-космонавт, ведущий инженер-испытатель 3-го отдела 1-го управления ЦПК.
Проходил подготовку в составе дублирующих и запасных экипажей по программам группового полета трех кораблей "Союз" (1969), "Алмаз" (1969), советско-кубинского полета на орбитальную станцию "Салют-6" (1979-1980).
25 декабря 1980 г. Евгений Хрунов выбыл из отряда космонавтов.
После завершения карьеры космонавта
С декабря 1980 г. был старшим научным сотрудником в 30-м Центральном научно-исследовательском институте Минобороны СССР.
В январе 1983 г., оставаясь на военной службе, Евгений Хрунов был прикомандирован к Главному техническому управлению Госкомитета СССР по внешним экономическим связям.
С 1983 г. являлся и. о. заместителя начальника, затем начальником управления Главного инженерного управления Министерства внешних экономических связей СССР (впоследствии госкомпания "Росвооружение", ныне АО "Рособоронэкспорт").
17 сентября 1989 г. Евгений Хрунов был уволен с военной службы в запас в звании полковника.
С ноября 1989 г. по январь 1990 г. - заместитель главного инженера специального автотранспортного предприятия ПО "Спецатом". Вахтовым методом участвовал в ликвидации последствий аварии на Чернобыльской АЭС.
С июля 1990 г. работал заместителем генерального директора, директором московского представительства межхозяйственного объединения "Консорциум "Содружество".
С июня 1991 г. был президентом научно-производственной ассоциации "К.Э.М.Т.".
В апреле 1995 г. стал генерал-лейтенантом казачьих войск, заместителем верховного атамана Великого братства казачьих войск России и зарубежья.
17 декабря 1995 г. баллотировался в Государственную думу РФ II созыва от блока независимых кандидатов, но депутатом избран не был.
Кончина
Евгений Хрунов скончался 19 мая 2000 г. в Москве, похоронен на Останкинском кладбище.
Награды
Герой Советского Союза (1969).
Был награжден орденами Ленина (1969), Красной Звезды (1961), а также Золотой медалью им. К. Э. Циолковского (Академия наук СССР), медалью де Лаво (FAI) и др.
Летчик-космонавт СССР (1969). Заслуженный мастер спорта СССР (1969).
Почетный гражданин Тулы (1969), Калуги (1969), Байконура (Казахстан, 1977) и др. городов.
Книги
Автор и соавтор книг "Космонавт в системе космической навигации" (1974), "Покорение невесомости: записки космонавта" (1976), "Оптические исследования в космосе" (1979), "На орбите вне корабля" (1977) и др. В 2008 г., уже после смерти Евгения Хрунова, вышла книга его воспоминаний "Космос - впереди ясная цель".