Родился 1 сентября 1970 г. в г. Прокопьевске Кемеровской области.
В 1993 г. окончил Кубанский государственный университет (КубГУ, Краснодар) по специальности "филолог, преподаватель русского языка". В 1995 г. получил в КубГУ второе высшее образование по специальности "юрист".
Кандидат юридических наук. В 2006 г. в Кубанском государственном аграрном университете защитил диссертацию на тему "Осуществление и защита права государственной собственности субъектов Российской Федерации".
В 1991-1994 гг. работал юридическим консультантом, заведовал юридическим сектором акционерного общества "Плутос" (Краснодар).
В 1994-1995 гг. был старшим юрисконсультом и ведущим специалистом юридического отдела управления делами администрации Краснодарского края.
С 1995 по 2001 г. являлся заместителем, затем первым заместителем начальника правового управления администрации Краснодарского края. В конце 1990-х гг. возглавил отдел систематизации и правовой экспертизы нормативных правовых актов краевой администрации.
В 2001-2003 гг. - заместитель руководителя аппарата, начальник правового управления администрации Краснодарского края.
С августа 2003 г. по июль 2014 г. занимал должность заместителя губернатора Краснодарского края Александра Ткачева, курировал вопросы имущественных, земельных и правовых отношений. Также в качестве заместителя главы региона руководил департаментом имущественных отношений Краснодарского края. Одновременно возглавлял региональное отделение Ассоциации юристов России.
В июле 2014 г. был назначен заместителем начальника Главного управления федерального имущества Управления делами президента РФ. С 30 июля того же года - и. о. начальника, с 23 января 2015 г. - начальник этого управления.
С 12 марта по 22 апреля 2015 г. - заместитель руководителя Управления делами президента РФ Владимира Кожина.
С 2015 г. возглавляет Краснодарский край.
22 апреля 2015 г. указом главы государства был назначен временно исполняющим обязанности главы администрации (губернатора) Краснодарского края. Сменил во главе региона Александра Ткачева, назначенного министром сельского хозяйства РФ.
13 сентября 2015 г. одержал победу на выборах губернатора Краснодарского края, получив 83,64% голосов (баллотировался от партии "Единая Россия"). Его ближайший соперник, депутат краевого заксобрания от КПРФ Николай Осадчий, набрал 7,88% голосов. 22 сентября того же года Вениамин Кондратьев вступил в должность.
В единый день голосования 13 сентября 2020 г. избран главой администрации (губернатором) Краснодарского края. За него проголосовали 82,97% избирателей (баллотировался от партии "Единая Россия"). Второе место занял секретарь комитета краевого отделения КПРФ Александр Сафронов с результатом 8,21%. 23 сентября того же года состоялась инаугурация избранного губернатора.
С ноября 2022 г. - губернатор Краснодарского края (в связи с переименованием должности руководителя субъекта РФ).
Член Государственного совета РФ.
Награжден орденом Александра Невского (2017).