Родился 28 февраля 1959 г. в г. Троицке Челябинской области.
В 1982 г. окончил электрофизический факультет Ленинградского электротехнического института им. В. И. Ульянова (ныне Санкт-Петербургский государственный электротехнический университет "ЛЭТИ" им. В. И. Ульянова/Ленина) по специальности "инженер-электротехник", в 1990 г. – Высшую коммерческую школу Академии внешней торговли. В 1990-1991 гг. проходил стажировку в Германии. В 1999 г. завершил обучение в Российской академии государственной службы при президенте РФ (ныне Российская академия народного хозяйства и государственной службы при президенте РФ).
Кандидат экономических наук. Тема диссертации "Валютная политика банка России и экономический рост" (2005; Санкт-Петербургский государственный университет экономики и финансов).
С 1982 по 1986 г. работал инструктором, заведующим отделом Петроградского районного комитета Всесоюзного ленинского коммунистического союза молодежи (ВЛКСМ).
В 1986–1991 гг. – инженер, старший инженер, ведущий инженер на ленинградском Научно-производственном объединении "Азимут".
В 1991–1993 гг. возглавлял российско-польское совместное предприятие "Азимут интернэшнл лтд" (Azimut International Ltd) в Санкт-Петербурге. Данное предприятие в 1991 г. было одним из первых зарегистрировано в Комитете по внешним связям мэрии Санкт-Петербурга. Входило в Ленинградскую (затем – Санкт-Петербургскую) ассоциацию совместных предприятий. В 1993-1994 гг. Владимир Кожин занимал пост генерального директора ассоциации.
В 1994 г. назначен руководителем Северо-Западного регионального центра по валютному и экспортному контролю Федеральной службы России по валютному и экспортному контролю (ФСВЭК) в Санкт-Петербурге. Занимал эту должность до 1999 г.
В 1999 г. переехал в Москву. С 20 сентября 1999 г. по 12 января 2000 г. - руководитель ФСВЭК России.
С 12 января 2000 г. по 12 мая 2014 г. - управляющий делами президента РФ (сменил на посту Павла Бородина). В 2000 г. возглавил Совет управляющих делами глав государств СНГ. Участвовал в подготовке и организации саммитов "Группы восьми" и "Большой двадцатки", АТЭС и ШОС, "Россия-Евросоюз". Курировал строительство конгресс-центра "Звездный путь" в Стрельне, реконструкцию Константиновского дворцово-паркового ансамбля в Стрельне, исторических зданий Сената и Синода в Санкт-Петербурге. Отвечал за создание Президентской библиотеки им. Бориса Ельцина (открыта 27 мая 2009 г. в Санкт Петербурге). Занимался реализацией проекта строительства российского православного духовно-культурного центра в Париже.
В 2014 г. перешел на работу в Администрацию президента РФ. С 12 мая 2014 г. по 13 июня 2018 г. был помощником главы государства, курировал вопросы военно-технического сотрудничества.
С мая 2014 г. являлся секретарем Комиссии по вопросам военно-технического сотрудничества Российской Федерации с иностранными государствами.
С 22 января 2015 г. по 23 июня 2018 г. - член Военно-промышленной комиссии РФ.
С 2018 г. - член Совета Федерации РФ (сенатор) от г. Москвы. Был наделен полномочиями сенатора - представителя от исполнительного органа власти столицы мэром Москвы Сергеем Собяниным 19 сентября 2018 г. и 18 сентября 2023 г. С октября 2018 г. по сентябрь 2023 г. был первым заместителем председателя комитета СФ по обороне и безопасности. С сентября 2023 г. - заместитель председателя комитета по конституционному законодательству и государственному строительству.
Был членом Российского организационного комитета "Победа", Совета при президенте РФ по развитию физической культуры и спорта, Наблюдательного совета Оргкомитета "Сочи-2014". С 2004 г. возглавлял совет президентов Ассоциации зимних олимпийских видов спорта. С 2005 г. - первый вице-президент Олимпийского комитета России (ОКР).
Член попечительского совета Всероссийского физкультурно-спортивного общества "Динамо".
Действительный государственный советник РФ I класса (1999).
Награжден орденами Почета (2003), "За заслуги перед Отечеством" II, III и IV степеней (2006, 2005, 2009), Дружбы (2010), Александра Невского (2014). Отмечен благодарностью (2007) и Почетной грамотой (2009) президента РФ.
Лауреат Государственной премии РФ 2003 г. в области науки и техники (присуждена за создание государственного комплекса "Дворец конгрессов" на базе памятника истории, культуры и архитектуры XVIII века дворцово-паркового ансамбля "Стрельна", г. Санкт-Петербург).
Почетный профессор Северо-Западной академии государственной службы.