Родился 3 марта 1966 г. в Москве.
В 1989 г. окончил Московский станкоинструментальный институт ("Станкин", ныне Московский государственный технологический университет "Станкин") с присвоением квалификации "инженер-системотехник", в 1992 г. - аспирантуру этого вуза.
Доктор экономических наук. В 2003 г. в Российской экономической академии им. Г. В. Плеханова защитил диссертацию на соискание ученой степени кандидата экономических наук по теме "Механизм государственного налогового администрирования в России". В 2010 г. в Академии народного хозяйства при правительстве РФ (ныне Российская академия народного хозяйства и государственной службы при президенте РФ, РАНХиГС) защитил докторскую диссертацию на тему "Стратегия формирования имущественного налогообложения в России".
Карьера в бизнесе и на государственной службе
В 1992-1995 гг. возглавлял тестовую лабораторию в Международном компьютерном клубе (МКК) в Москве. В 1995–1996 гг. был заместителем генерального директора МКК, в 1996–1998 гг. - председателем правления Международного компьютерного клуба.
В 1998 г. - помощник руководителя, заместитель руководителя Государственной налоговой службы РФ, на базе которой 23 декабря 1998 г. было образовано Министерство РФ по налогам и сборам.
С марта 1999 г. по март 2004 г. - заместитель министра РФ по налогам и сборам.
С 22 марта 2004 г. по 18 декабря 2006 г. - руководитель Федерального агентства кадастра объектов недвижимости (Роснедвижимость; упразднено в марте 2009 г.).
С 18 декабря 2006 г. по 29 февраля 2008 г. - руководитель Федерального агентства по управлению особыми экономическими зонами (РосОЭЗ; упразднено в октябре 2009 г.).
В 2008–2010 гг. Михаил Мишустин занимал должность президента группы компаний UFG ("ОФГ инвест"), одной из крупнейших в России компаний в сфере управления активами, прямыми инвестициями, а также паевыми инвестиционными фондами. Одновременно был научным руководителем Института экономики недвижимости государственного университета "Высшая школа экономики".
Во главе Федеральной налоговой службы
С 6 апреля 2010 г. по 16 января 2020 г. Михаил Мишустин руководил Федеральной налоговой службой РФ (ФНС России). Во главе ведомства сменил Михаила Мокрецова.
За время работы Михаила Мишустина в ФНС была внедрена автоматизированная система налогового администрирования "Налог-3", объединившая все функции службы. В 2012 г. на сайте ведомства заработала система т. н. личных кабинетов для налогоплательщиков, позволяющая платить налоги и задолженности онлайн. В 2016 г. был создан Единый реестр субъектов малого и среднего предпринимательства. Были введены специальный налог для самозанятых, а также система возврата суммы налога на добавленную стоимость (tax free). В 2018 г. ведомство ввело в эксплуатацию Единый государственный реестр записей актов гражданского состояния. В 2019 г. был завершен переход на новый порядок применения контрольно-кассовой техники, предусматривающий передачу информации о расчетах в адрес налоговых органов в режиме онлайн. В целом к 2020 г. действовало свыше 50 электронных сервисов ФНС.
Параллельно с работой на посту главы ФНС Михаил Мишустин в октябре 2013 г. занял должность научного руководителя факультета налогов и налогообложения (ныне факультет налогов, аудита и бизнес-анализа) Финансового университета при правительстве РФ. Продолжает работать в этой должности вплоть до настоящего времени.
Председатель правительства РФ
15 января 2020 г., после отставки правительства Дмитрия Медведева, президент РФ Владимир Путин внес в Госдуму кандидатуру Михаила Мишустина на пост председателя правительства. На следующий день депутаты дали согласие на назначение премьера (за - 383, воздержался 41, против не было), а глава государства назначил его премьером.
С 16 января 2020 г. - председатель правительства РФ.
С 30 апреля по 19 мая 2020 г. находился на лечении в связи с заболеванием, вызванным коронавирусной инфекцией нового типа. В этот период и. о. председателя правительства был первый вице-премьер Андрей Белоусов.
7 мая 2024 г. кабинет Михаила Мишустина ушел в отставку перед избранным президентом Владимиром Путиным, после чего продолжил исполнять свои обязанности. 9 мая президент РФ вновь внес в Госдуму кандидатуру Михаила Мишустина на пост главы правительства. 10 мая депутаты поддержали это назначение (375 из 448 проголосовали за, 57 - воздержались, голосов против не было). В тот же день Михаил Мишустин был назначен главой кабмина указом президента РФ.
Постоянный член Совета безопасности РФ (с 16 января 2020 г.).
Участие в различных коллегиальных органах
Заместитель председателя Совета при президенте РФ по стратегическому развитию и национальным проектам (с февраля 2020 г.), председатель президиума совета.
Возглавляет Координационный совет при правительстве РФ по обеспечению потребностей Вооруженных сил РФ, других войск, воинских формирований и органов (с октября 2022 г.).
Председатель правительственных комиссий по повышению устойчивости российской экономики в условиях санкций, по модернизации экономики и инновационному развитию России, по бюджетным проектировкам на очередной финансовый год и плановый период, по цифровому развитию, использованию информационных технологий для улучшения качества жизни и условий ведения предпринимательской деятельности, по контролю за осуществлением иностранных инвестиций в РФ, по вопросам развития малого и среднего предпринимательства.
Руководит Консультативным советом по иностранным инвестициям в России и Координационным советом при правительстве РФ по борьбе с распространением новой коронавирусной инфекции на территории РФ.
Входил в состав Совета при президенте РФ по развитию финансового рынка РФ (2011-2018). Возглавлял наблюдательный совет государственной корпорации развития "ВЭБ.РФ" (2020). Был членом правления Федерации хоккея России, ученого совета РАНХиГС.
Классный чин, награды, книги
Действительный государственный советник РФ I класса (2010).
Награжден орденами Почета (2012), "За заслуги перед Отечеством" IV степени (2015). Отмечен Почетной грамотой президента РФ (2013) и благодарностью правительства РФ (2016).
Имеет ордена преподобного Серафима Саровского III степени (2019) и Даниила Московского I степени (2021) Русской православной церкви.
Автор монографии "Информационно-технологические основы государственного налогового администрирования в России" (2005).