Родился 11 февраля 1969 г. в г. Арске (Татарская АССР, ныне Республика Татарстан, РФ).
В 1993 г. окончил юридический факультет Казанского государственного университета им. В. И. Ульянова-Ленина (КГУ; ныне Казанский, Приволжский, федеральный университет, КФУ) по специальности "правоведение". В 2000 г. получил диплом Казанского финансово-экономического института (КФЭИ; с 2011 г. - в составе КФУ) по специальности "менеджмент".
Кандидат юридических наук. В 2004 г. в Казанском госуниверситете защитил диссертацию на тему "Ответственность осужденных за злостное уклонение от наказаний, не связанных с изоляцией от общества в российском уголовном праве".
В 1993-1995 гг. был ассистентом кафедры истории и права КФЭИ.
В 1995-1998 гг. работал старшим преподавателем кафедры уголовного права Казанского государственного университета.
В 1998-2008 гг. - доцент кафедры уголовного права и криминологии КГУ.
В 2008-2009 гг. - заместитель директора по экономике и финансам, в 2009-2010 гг. - директор Государственного казенного учреждения "Главтатдортранс".
С 2010 по 2020 г. - министр транспорта и дорожного хозяйства Республики Татарстан. Был назначен 22 апреля 2010 г. был назначен министром транспорта и дорожного хозяйства в правительстве Ильдара Халикова. Сохранил пост после того, как кабинет министров республики возглавил Алексей Песошин в апреле 2017 г.
С 2020 по 2022 г. - член Совета Федерации РФ. 18 сентября 2020 г. президент Татарстана Рустам Минниханов, избранный на очередной срок, наделил Ленара Сафина полномочиями сенатора, представителя от исполнительного органа власти республики. В Совфеде Ленар Сафин сменил Олега Морозова, который перешел в нижнюю палату парламента. С ноября 2020 г. занимал пост первого заместителя председателя комитета СФ по экономической политике. В сентябре 2022 г. подал заявление о сложении полномочий сенатора в связи с назначением ректором Казанского федерального университета.
19 августа 2022 г. распоряжением правительства РФ Ленар Сафин был назначен ректором Казанского (Приволжского) федерального университета сроком на пять лет.
Сумма декларированного дохода за 2019 г. составила 4 млн 85 тыс. руб., супруги - 2 млн 295 тыс. руб.
Сумма декларированного дохода за 2020 г. составила 4 млн 948 тыс. руб., супруги - 3 млн 216 тыс. руб.
Сумма декларированного дохода за 2021 г. составила 5 млн 719 тыс. руб., супруги - 3 млн 74 тыс. руб.
Награжден орденом Почета (2019), медалью ордена "За заслуги перед Отечеством" II степени (2014), медалью "За доблестный труд" (2018). Имеет благодарность президента РФ (2017).
Почетный работник транспорта России (2013), заслуженный строитель Республики Татарстан (2016).