Родилась 8 мая 1981 г. в Краснодаре.
В 2003 г. окончила Кубанский государственный аграрный университет по специальности "бухгалтерский учет, анализ и аудит".
С 2006 по 2014 г. занимала должности государственного налогового инспектора, старшего государственного налогового инспектора, главного государственного налогового инспектора, заместителя начальника отдела, начальника отдела, заместителя начальника инспекции в Межрегиональной инспекции Федеральной налоговой службы по крупнейшим налогоплательщикам №7 (Москва).
В 2014-2017 гг. была начальником отдела организации налогового контроля юридических лиц, затем заместителем начальника контрольного управления Федеральной налоговой службы РФ.
С 2017 по 2020 г. - начальник управления трансфертного ценообразования Федеральной налоговой службы.
С 24 января 2020 г. - заместитель руководителя Федеральной налоговой службы Даниила Егорова. Юлия Шепелева контролирует деятельность управлений ФНС по крупнейшим налогоплательщикам, трансфертного ценообразования, международного сотрудничества и валютного контроля.
Сумма декларированного дохода за 2020 г. составила 13 млн 752 тыс. руб.
Действительный государственный советник РФ III класса (2021).