Родилась 22 сентября 1947 г. в гор. Фрунзе (Киргизская ССР; ныне гор. Бишкек, Киргизия) в семье Асанбека Токомбаева и Мунжии Еркинбаевой. Ее отец был партийным и общественным деятелем, в 1960-х - 1980-х гг. возглавлял Комитет по телевидению и радио при Совете министров Киргизской ССР. Мать - оперная певица, одна из основоположниц киргизского профессионального музыкального искусства.
В 1966 г. Айсулу Токомбаева окончила Ленинградское академическое хореографическое училище им. А. Я. Вагановой (ныне Академия русского балета им. А. Я. Вагановой) по балетному классу педагога Нины Беликовой.
В 1966 г. была принята в балетную труппу Киргизского государственного (ныне национального) академического театра оперы и балета им. А. Малдыбаева, через год стала ее солисткой. Среди исполненных ею партий: Жизель в одноименном балете Адольфа Адана, Никия в "Баядерке" Людвига Минкуса, Одетта-Одиллия в "Лебедином озере" и Аврора в "Спящей красавице" Петра Чайковского, Фригия в "Спартаке" Арама Хачатуряна, Мария в "Бахчисарайском фонтане" Бориса Асафьева, Джульетта в "Ромео и Джульетте" Сергея Прокофьева, Ширин и Мехменэ Бану в "Легенде о любви" Арифа Меликова, Асель в одноименном балете Владимира Власова. Постоянным сценическим партнером Айсулу Токомбаевой был народный артист СССР Чолпонбек Базарбаев (1949-2002). Завершила балетную карьеру в середине 1990-х гг.
С 1995 г. Айсулу Токомбаева преподает классический танец на балетном отделении Анкарской государственной консерватории (входит в структуру университета "Хаджеттепе", Анкара, Турция).
В 2012 г. возглавляла жюри Международного конкурса балетного искусства "Ак-Куу" (Бишкек).
Народная артистка СССР (1981).
Лауреат Государственной премии СССР в области литературы, искусства и архитектуры (1976).
Почетный профессор Киргизского государственного университета культуры и искусств им. Б. Бейшеналиевой (1998).
Была замужем за Кубаном Алиевым (работал директором Киргизского государственного театра кукол им. М. Жангазиева, скончался в 2000-х гг.).