26 января 2000 г. на Октябрьской железной дороге на перегоне Торбино-Мстинский мост произошло столкновение пассажирского поезда, в котором находились 139 человек, с грузовым составом. В результате погиб помощник машиниста, 3 человека были госпитализированы.
25 июня 2000 г. в Хабаровском крае произошла авария пассажирского поезда, следовавшего по маршруту Комсомольск-на-Амуре - Ургал. В результате разрыва рельса локомотив и три вагона опрокинулись. Из 214 пассажиров пострадали 7 человек.
25 сентября 2001 г. в Ростовской области на Северо-Кавказской железной дороге с рельсов сошли локомотив и шесть вагонов пассажирского поезда сообщением Ростов - Баку. В результате аварии 16 пассажиров были ранены.
1 апреля 2002 г. в Москве недалеко от Ярославского вокзала столкнулись пассажирский поезд "Москва - Хабаровск" и маневровый локомотив. В результате аварии 41 человек получил ранения, на несколько часов было остановлено движение поездов на участке Ярославской железной дороги.
11 ноября 2002 г. 4 человека погибли и 5 человек получили ранения в результате аварии электропоезда на Балтийском вокзале Санкт-Петербурга. Из-за неисправности тормозной системы два вагона состава выехали с путей под шатровую часть вокзала, где находились пассажиры.
17 июня 2007 г. в Воронежской области на одном из перегонов локомотив пассажирского поезда сообщением Челябинск - Симферополь врезался в хвостовую часть грузового состава, стоявшего на перегоне. В результате аварии пострадали 64 человека.
10 июля 2007 г. под Екатеринбургом на Свердловской железной дороге из-за поломки одного из вагонов сошли с рельсов 11 вагонов пассажирского поезда, следовавшего из Екатеринбурга в Приобье. Пострадали 9 человек.
12 июня 2008 г. в Амурской области на Забайкальской железной дороге из-за искривления рельсов произошла авария пассажирского поезда сообщением Нерюнгри - Хабаровск. Десять вагонов сошли с рельсов и опрокинулись. В поезде находились более 400 человек, в результате аварии пострадали 60 человек.
10 октября 2009 г. в Тамбовской области пассажирский поезд сообщением Москва - Тамбов въехал в стоявший на путях локомотив. Поезд с рельсов не сошел, однако часть локомотива и первые вагоны поезда получили повреждения. В результате аварии пострадали 33 человек.
17 сентября 2010 г. в Архангельской области на Северной железной дороге 8 пассажиров поезда сообщением Москва - Северодвинск получили травмы в результате наезда на состав локомотива из-за отказа его тормозной системы. ЧП произошло во время стоянки пассажирского поезда.
9 ноября 2011 г. в Воронежской области на станции "Воронеж-1" произошло столкновение маневрового локомотива с хвостовым вагоном пассажирского поезда "Новосибирск - Белгород". В результате аварии пострадали 11 человек.
13 октября 2012 г. на Урале на железнодорожной станции "Каменск-Уральский" столкнулись пассажирский поезд сообщением Адлер - Нижний Тагил с электровозом. В поезде находились 306 пассажиров, четверо получили ранения.
7 июля 2013 г. в Краснодарском крае на перегоне Кисляковская-Крыловская сошел с рельсов пассажирский поезд, следовавший по маршруту Адлер - Новосибирск. Пять вагонов опрокинулись. В поезде находились 618 пассажиров. В результате аварии пострадали 108 человек, 15 из них был госпитализированы.
6 декабря 2013 г. в Москве возле станции "Москва-Сортировочная-Киевская" электропоезд из Ново-Переделкино столкнулся с буровой установкой, выполнявшей спецработы на путях. В результате ЧП были разбиты несколько стекол в трех вагонах и осколками нанесены повреждения четырем пассажирам.
