Родился 23 ноября 1956 г. в Челябинске в семье рабочего.
В 1979-1980 гг. учился на подготовительном факультете в Московском государственном институте международных отношений МИД СССР (ныне МГИМО МИД России).
В 1985 г. окончил факультет журналистики Московского государственного университета (МГУ) им. М. В. Ломоносова. В 2009 г. заочно окончил юридический факультет Института экономики и культуры (Москва) по специальности "юриспруденция".
После окончания МГУ вернулся в Челябинск, где в 1985-1986 гг. работал корреспондентом газеты "Вечерний Челябинск".
В 1986 г. переехал в Москву. Был корреспондентом в редакции пропаганды Всесоюзного радио, затем ведущим программ "Время, события, люди", "Человек и закон". Тогда же создал радиопрограмму "Карьера".
В 1991 г. перешел на Центральное телевидение СССР, позднее работал во Всероссийской государственной телевизионной и радиовещательной компании (ВГТРК). Являлся автором и ведущим ток-шоу "Карьера" (затем "Конкурс менеджеров"), гостями которой были политики, бизнесмены, представители искусства и культуры.
В 1997-2000 гг. - директор по связям с общественностью Международного фонда экономических и социальных реформ (фонд "Реформа"), который возглавлял Мартин Шаккум.
В 2000 г. занимал пост первого заместителя председателя Комитета по делам печати и информации Московской области Елены Марковой.
В 2001 г. вернулся на телевидение, где работал вплоть до 2004 г. продюсером информационного вещания на канале НТВ, затем исполнительным продюсером телеканала "Россия".
С 2004 по 2007 г. - директор по связям с общественностью Фонда интеллектуальных технологий, который занимался вопросами сотрудничества органов власти с научными и общественными организациями, а также промышленными предприятиями.
После образования в сентябре 2007 г. Следственного комитета при прокуратуре РФ (СКП РФ; руководитель - Александр Бастрыкин) Владимир Маркин был назначен руководителем управления взаимодействия со средствами массовой информации СКП. В 2008-2009 гг. также занимал должность заместителя председателя редакционной коллегии и главного редактора журнала "Вестник Следственного комитета при прокуратуре Российской Федерации".
В январе 2011 г. на базе СКП РФ был создан Следственный комитет (СК) РФ, федеральный государственный орган, осуществляющий полномочия в сфере уголовного судопроизводства. СК РФ возглавил Александр Бастрыкин. До июня 2011 г. Владимир Маркин исполнял обязанности главы управления взаимодействия со СМИ.
С 20 июня 2011 г. по 6 октября 2016 г. - руководитель управления взаимодействия со средствами массовой информации СК РФ.
Получил широкую известность благодаря ведению активной информационной политики, в частности, в социальных сетях. В комментариях СМИ не только озвучивал официальную позицию СК, но и высказывал свою личную точку зрения на актуальные общественно-политические события.
В августе 2011 г. участвовал в праймериз Общероссийского народного фронта (ОНФ) в Волгограде, в ходе которых определялись претенденты на выдвижение кандидатами в депутаты Госдумы по региональному списку "Единой России". По итогам праймериз занял 13 место и не вошел в десятку кандидатов.
В августе 2011 г. участвовал в праймериз Общероссийского народного фронта (ОНФ) в Волгограде, в ходе которых определялись претенденты на выдвижение кандидатами в депутаты Госдумы по региональному списку "Единой России". По итогам голосования занял 13 место и не вошел в десятку кандидатов.
В 2014 г. был ведущим цикла из четырех документальных исторических фильмов "Преданная Россия" на телеканале "Звезда". С октября 2015 г. вел передачу "Следствие покажет с Владимиром Маркиным" на Первом канале.
С 12 октября 2016 г. по 24 февраля 2019 г. - первый заместитель генерального директора ПАО "Русгидро" Николая Шульгинова. С января 2017 г. входил в правление "Русгидро".
С ноября 2016 г. занимал пост председателя комитета Российского футбольного союза по безопасности и работе с болельщиками.
12 октября 2021 г. пресс-служба СК РФ сообщила о смерти Владимира Маркина.
Являлся членом Общественного совета при СК РФ (с 2016 г.).
Общая сумма декларированного годового дохода за 2014 г. составила 6 млн 847 тыс. 875 руб.
Общая сумма декларированного годового дохода за 2015 г. составила 2 млн 625 тыс. руб., у супруги, согласно декларации, доходов не было.
Государственный советник юстиции III класса (2010).
Генерал-майор юстиции (2011).
Был награжден орденом Дружбы (2012), ведомственными медалями.
Снимался в эпизодических ролях в телевизионных сериалах "СК", "Пятницкий", фильмах "День дурака", "Духлесс 2".
Совместно с российским певцом Станиславом Пьехой записал композицию "Родина" на музыку Виктора Дробыша, которая впервые была исполнена ими в 2015 г. на Первом канале в программе "Кто хочет стать миллионером".
Автор книги "Самые громкие преступления XXI века в России" (изд. "Эксмо", 2016). В сентябре 2016 г. ряд журналистов, в том числе Надежда Прусенкова ("Новая газета") и Илья Барабанов ("Коммерсант"), сообщили, что в книге Маркина были использованы фрагменты их статей без указания авторства. Владимир Маркин обвинил журналистов в желании "раскрутиться на его имени", но через несколько дней извинился, сообщив, что некорректное цитирование материалов произошло по вине издательства. В свою очередь "Эксмо" заявило, что фрагменты статей других авторов в книге Маркина должны были быть оформлены как цитаты, "однако это не было сделано из-за технической ошибки".
Был женат, имел дочь.