Родился 7 мая 1934 г. в Одессе (Украинская ССР, ныне Украина).
В 1957 г. окончил Одесский гидротехнический институт (ныне Одесская государственная академия строительства и архитектуры) по специальности "инженер-мостостроитель", в 1963 г. - экономический факультет Московского государственного университета им. М. В. Ломоносова по специальности "политическая экономия".
Доктор экономических наук. В 1968 г. на экономическом факультете МГУ защитил кандидатскую диссертацию на тему "Методологические вопросы изучения и совершенствования системы экономической информации в промышленности". В 1976 г. в Центральном экономико-математическом институте Академии наук (АН) СССР защитил докторскую диссертацию на тему "Методологические проблемы исследования системы экономической информации". Профессор.
В 1957 г. работал мастером в Мостопоезде №478 треста Мостостроя №3 Минтрансстроя СССР.
С 1958 по 1960 г. - инженер проектного института №3 Госстроя Украинской ССР.
В 1964-1973 гг. занимал должности заведующего отделом, затем заведующего лабораторией в НИИ Центрального статистического управления при Совете министров СССР.
С 1971 г. и до конца 1980-х гг. преподавал (по совместительству) на экономическом факультете МГУ.
С 1973 по 1989 г. - заведующий лабораторией Центрального экономико-математического института АН СССР.
В 1989-1991 гг. возглавлял отдел Государственной комиссии Совета Министров СССР по экономической реформе.
Евгений Ясин был одним из идеологов реформ начала 1990-х гг., соратником Егора Гайдара и Анатолия Чубайса.
В 1990 г. он принял участие в разработке программы "500 дней" по переходу СССР к рыночной экономики, основными авторами которой были заведующий экономического отдела Совета министров СССР Григорий Явлинский и академик Станислав Шаталин. Программа так и не была реализована.
С 1991 по 1994 г. был генеральным директором Дирекции по экономической политике Научно-промышленного союза СССР под руководством Аркадия Вольского (в 1991 г. организация была переименована в Российский союз промышленников и предпринимателей - РСПП).
В ноябре 1991 г. создал и возглавил Экспертный институт РСПП (с 2009 г. - научно-просветительский Фонд "Экспертный Институт").
С 1992 по 1993 г. совмещал работу директора Экспертного института РСПП с обязанностями полномочного представителя правительства России в Верховном совете РФ.
В 1993 г. был назначен руководителем рабочей группы по экономической программе при председателе правительства РФ Викторе Черномырдине.
С апреля по ноябрь 1994 г. возглавлял Аналитический центр при президенте РФ.
С 8 ноября 1994 г. по 17 марта 1997 г. занимал пост министра экономики РФ в правительстве Виктора Черномырдина, сменил на этом посту Александра Шохина.
С 26 марта 1997 г. по 23 марта 1998 г. был министром без портфеля в том же составе кабинета министров, отвечал за экономический блок. После отставки Черномырдина с поста премьер-министра, вошел в кабинет Сергея Кириенко. Входил в состав различных правительственных комиссий, однако формальный круг его должностных обязанностей определен не был. Покинул правительство в июле 1998 г. (указ об отставке не публиковался).
До ноября 1998 г. был представителем РФ (заместителем управляющего) в Международном банке реконструкции и развития и Многостороннем агентстве по гарантиям инвестиций.
С октября 1998 г. по 2021 г. был научным руководителем Высшей школы экономики (ныне Национальный исследовательский университет "Высшая школа экономики", НИУ ВШЭ). 1 июля 2021 г. члены ученого совета НИУ ВШЭ избрали Евгения Ясина почетным научным руководителем университета.
С февраля 2000 г. по сентябрь 2019 г. возглавлял Фонд "Либеральная миссия".
В мае 2001 г. на учредительном съезде партии "Союз правых сил" Евгений Ясин был избран в политсовет организации (ее сопредседателями являлись Анатолий Чубайс, Егор Гайдар, Борис Немцов и Ирина Хакамада), переизбран в январе 2004 г. Евгений Ясин занимал этот пост до декабря 2007 г.
В 2008-2010 гг. - член Общественной палаты РФ, входил в комиссию по образованию и науки.
В 2011-2013 гг. - был руководителем экспертной группы по направлению "Новая модель экономического роста. Обеспечение макроэкономической и социальной стабильности" в "Стратегии-2020" - проекте по созданию новой экономической государственной программы, разработанной НИУ ВШЭ и Российской академии народного хозяйства и государственной службы при президенте РФ.
С 2018 г. - председатель общественной организации "Комитета гражданских инициатив" (основатель – Алексей Кудрин).
В 2018 г. включен в состав Совета при президенте РФ по развитию гражданского общества и правам человека.
Награжден орденом Почета (2009), орденами "За заслуги перед Отечеством" III и IV степеней (2012, 2002), медалью Столыпина I и II степеней (2017, 2012). Отмечен благодарностью (2004) и Почетной грамотой (2002) правительства РФ.
Автор книг "Хозяйственные системы и радикальная реформа" (1989), "Как поднять экономику России" (1996), "Приживется ли демократия в России" (2005), "Сценарии развития России на долгосрочную перспективу" (2011) и др.
Вдовец. Был женат на Лидии Ясиной (1939-2012). Дочь - Ирина (род. 1964), экономист и публицист.