Родился 7 мая 1934 г. в Одессе (Украинская ССР, ныне Украина).
В 1957 г. окончил Одесский гидротехнический институт (ныне Одесская государственная академия строительства и архитектуры) по специальности "инженер-мостостроитель", в 1963 г. - экономический факультет Московского государственного университета им. М. В. Ломоносова по специальности "политическая экономия".
Доктор экономических наук. В 1968 г. на экономическом факультете МГУ защитил кандидатскую диссертацию на тему "Методологические вопросы изучения и совершенствования системы экономической информации в промышленности". В 1976 г. в Центральном экономико-математическом институте Академии наук (АН) СССР защитил докторскую диссертацию на тему "Методологические проблемы исследования системы экономической информации". Профессор.
В 1957 г. работал мастером в Мостопоезде №478 треста Мостостроя №3 Минтрансстроя СССР.
С 1958 по 1960 г. - инженер проектного института №3 Госстроя Украинской ССР.
В 1964-1973 гг. занимал должности заведующего отделом, затем заведующего лабораторией в НИИ Центрального статистического управления при Совете министров СССР.
С 1971 г. и до конца 1980-х гг. преподавал (по совместительству) на экономическом факультете МГУ.
С 1973 по 1989 г. - заведующий лабораторией Центрального экономико-математического института АН СССР.
В 1989-1991 гг. возглавлял отдел Государственной комиссии Совета министров СССР по экономической реформе.
Евгений Ясин был одним из идеологов реформ начала 1990-х гг., соратником Егора Гайдара и Анатолия Чубайса.
В 1990 г. он принял участие в разработке программы "500 дней" по переходу СССР к рыночной экономики, основными авторами которой были заведующий экономическим отделом Совета министров СССР Григорий Явлинский и академик Станислав Шаталин. Программа так и не была реализована.
С 1991 по 1994 г. был генеральным директором Дирекции по экономической политике Научно-промышленного союза СССР под руководством Аркадия Вольского (в 1991 г. организация была переименована в Российский союз промышленников и предпринимателей - РСПП).
В ноябре 1991 г. создал и возглавил Экспертный институт РСПП (с 2009 г. - научно-просветительский фонд "Экспертный институт").
С 1992 по 1993 г. совмещал работу директором Экспертного института РСПП с обязанностями полномочного представителя правительства России в Верховном совете РФ.
В 1993 г. был назначен руководителем рабочей группы по экономической программе при председателе правительства РФ Викторе Черномырдине.
С апреля по ноябрь 1994 г. возглавлял Аналитический центр при президенте РФ.
С 8 ноября 1994 г. по 17 марта 1997 г. занимал пост министра экономики РФ в правительстве Виктора Черномырдина, сменил на этом посту Александра Шохина.
С 26 марта 1997 г. по 23 марта 1998 г. был министром без портфеля в том же составе кабинета министров, отвечал за экономический блок. После отставки Черномырдина с поста премьер-министра, вошел в состав кабинета Сергея Кириенко. Входил в состав различных правительственных комиссий, однако формальный круг его должностных обязанностей определен не был. Покинул правительство в июле 1998 г. (указ об отставке не публиковался).
До ноября 1998 г. был представителем РФ (заместителем управляющего) в Международном банке реконструкции и развития и Многостороннем агентстве по гарантиям инвестиций.
С октября 1998 г. по 2021 г. был научным руководителем Высшей школы экономики (ныне Национальный исследовательский университет "Высшая школа экономики", НИУ ВШЭ). До 2019 г. на факультете экономических наук вел курс "Российская экономика". 1 июля 2021 г. члены ученого совета НИУ ВШЭ избрали Евгения Ясина почетным научным руководителем университета.
С февраля 2000 г. по сентябрь 2019 г. возглавлял Фонд "Либеральная миссия".
В мае 2001 г. на учредительном съезде партии "Союз правых сил" Евгений Ясин был избран в политсовет организации (ее сопредседателями являлись Анатолий Чубайс, Егор Гайдар, Борис Немцов и Ирина Хакамада), переизбран в январе 2004 г. Евгений Ясин занимал этот пост до декабря 2007 г.
В 2008-2010 гг. - член Общественной палаты РФ, входил в комиссию по образованию и науки.
В 2011-2013 гг. - был руководителем экспертной группы по направлению "Новая модель экономического роста. Обеспечение макроэкономической и социальной стабильности" в "Стратегии-2020" - проекте по созданию новой экономической государственной программы, разработанной НИУ ВШЭ и Российской академии народного хозяйства и государственной службы при президенте РФ.
В 2018-2020 гг. - председатель общественной организации "Комитета гражданских инициатив" (основатель – Алексей Кудрин).
В 2018-2023 гг. - член Совета при президенте РФ по развитию гражданского общества и правам человека.
Скончался 25 сентября 2023 г. на 90-м году жизни.
Был награжден орденами Почета (2009), "За заслуги перед Отечеством" III и IV степеней (2012, 2002), медалью Столыпина I и II степеней (2017, 2012). Был отмечен благодарностью (2004) и Почетной грамотой (2002) правительства РФ.
Автор книг "Хозяйственные системы и радикальная реформа" (1989), "Как поднять экономику России" (1996), "Приживется ли демократия в России" (2005), "Сценарии развития России на долгосрочную перспективу" (2011), "Девяностые - годы тягот, надежд и свершений" (2019) и др.