Родился 14 июня 1953 г. в д. Дергаево Раменского района Московской области.
В 1976 г. окончил Московский авиационный технологический институт имени К. Э. Циолковского (ныне - Российский государственный технологический университет имени К. Э. Циолковского), в 1987 г. - Московскую высшую партийную школу, в 2001 г. - Российскую академию народного хозяйства и государственной службы при президенте РФ.
Кандидат экономических наук. В 1999 г. защитил диссертацию на тему "Управление технологическим освоением производства наукоемкой продукции в промышленных организациях с акционерной формой собственности".
В 1970—1976 гг. работал слесарем-сборщиком, инженером на Раменском приборостоительном заводе.
Был членом КПСС.
В 1976—1984 гг. - инструктор, заведующий организационным отделом, второй секретарь, первый секретарь Раменского горкома ВЛКСМ Московской области.
В 1984—1986 гг. - главный инженер Раменского филиала Московского производственного объединения (МПО) "Электрозавод" им. В. В. Куйбышева.
С 1986 по 1990 г. был вторым секретарем Раменского горкома КПСС.
В 1990—1997 гг. - директор, генеральный директор Раменского филиала МПО "Электрозавод" им. В. В. Куйбышева (с сентября 1996 г. - ОАО "Раменский электротехнический завод "Энергия").
В 1997—1999 гг. - депутат Московской областной думы, председатель комитета по проблемам народно-хозяйственного комплекса и развития инфраструктуры.
Одновременно в 1998—1999 гг. занимал пост генерального директора ОАО "Раменский электротехнический завод "Энергия".
В 1999-2016 гг. - депутат Государственной думы РФ.
19 декабря 1999 г. был избран депутатом Государственной думы РФ III созыва (2000-2003). Баллотировался по Люберецкому одномандатному избирательному округу №107 Московской области от избирательного блока "Отечество — Вся Россия" (ОВР), на выборах получил 17,85% (второе место - кандидат от КПРФ Александр Сколов, 14,44%). В Думе Юрий Липатов был заместителем председателя комитета по энергетике, транспорту и связи. Входил во фракцию ОВР. В 2000 вошел в состав депутатского межфракционного объединения Государственной Думы "Деловая Россия".
Был заместителем председателя Московского регионального отделения партии "Единство и Отечество" - Единая Россия" (с 24 декабря 2003 г. - "Единая Россия").
7 декабря 2003 г. стал депутатом Госдумы IV созыва (2004—2007). Был избран по общефедеральному списку "Единой России" (№4 в региональной группе от Московской области). Заместитель председателя комитета ГД по энергетике, транспорту и связи, член фракции "Единая Россия".
2 декабря 2007 г. избран в Государственную думу V созыва (2008—2011). Баллотировался по списку партии "Единая Россия" (десятый номер в региональной группе №54, Московская область). Председатель думского комитета по энергетике. Был членом комиссий по расследованию обстоятельств, связанных с возникновением чрезвычайной ситуации техногенного характера на Саяно-Шушенской ГЭС 17 августа 2009 г., по законодательному обеспечению деятельности субъектов естественных монополий, государственных корпораций и коммерческих организаций с государственным участием. Член фракции "Единая Россия".
С 4 декабря 2011 г. - депутат Госдумы РФ VI созыва (2011—2016). Избран в составе списка партии "Единая Россия", баллотировался под седьмым номером в региональной группе №52, Московская область. В Думе был первым заместителем председателя комитета по энергетике, первым заместителем руководителя фракции "Единая Россия".
С 30 сентября 2016 г. по 26 сентября 2018 г. - член Совета Федерации РФ, представитель от исполнительного органа государственной власти Московской области. С сентября 2017 г. являлся заместителем председателя комитета СФ по экономической политике.
Общая сумма декларированного дохода за 2017 г. составила 17 млн 921 тыс. руб., супруги - 503 тыс. руб.
Награжден орденами Дружбы (1997), Почета (2003), "За заслуги перед Отечеством" IV степени (2008).
Имеет Почетную грамоту (2013) и благодарность (2008) правительства РФ.
Награжден орденом Русской православной церкви Святого благоверного князя Даниила Московского III степени (2008).
Заслуженный энергетик Российской Федерации (2014).
Лауреат Премии правительства РФ в области науки и техники (2004).
Почетный гражданин Раменского муниципального района (2014).